Η θεωρία των δύο εθνών (Ουρντού: دو قومی نظریہ do qaumī nazariya) αποτελεί τη βάση για τη δημιουργία του Πακιστάν. Η θεωρία των δύο εθνών με τον απλούστερο τρόπο σημαίνει ότι οι πολιτιστικές, πολιτικές, θρησκευτικές, οικονομικές και κοινωνικές ανισότητες μεταξύ των δύο μεγάλων κοινοτήτων, των Ινδουιστών και των Μουσουλμάνων της υποηπείρου. Αυτές οι διαφορές προοπτικής, στην πραγματικότητα, συνέβαλαν σε μεγάλο βαθμό στη δημιουργία δύο διαφορετικών πολιτικών ιδεολογιών, οι οποίες ήταν υπεύθυνες για τον διαμελισμό της υποηπείρου σε δύο ανεξάρτητα κράτη. Η θεωρία των δύο εθνών αποτέλεσε ιδρυτική αρχή του Πακιστανικού Κινήματος (δηλαδή της ιδεολογίας του Πακιστάν ως μουσουλμανικού έθνους-κράτους στη Νότια Ασία) και του διαμελισμού της Ινδίας το 1947.
Η ιδεολογία ότι η θρησκεία είναι ο καθοριστικός παράγοντας για τον προσδιορισμό της εθνικότητας των Ινδών μουσουλμάνων και ινδουιστών διατυπώθηκε από τον Μοχάμεντ Αλί Τζινά, ο οποίος την χαρακτήρισε ως την αφύπνιση των μουσουλμάνων για τη δημιουργία του Πακιστάν. Κατά συνέπεια, προκάλεσε τη δημιουργία πολλών ινδουιστικών εθνικιστικών οργανώσεων, με σκοπούς, μεταξύ άλλων, την προσπάθεια να καταστεί η Ινδία ένα παρόμοιο κράτος για την πλειοψηφία των ινδουιστών που κατοικούν εκεί.
Υπάρχουν διαφορετικές ερμηνείες της θεωρίας των δύο εθνών, με βάση το αν οι δύο υποτιθέμενες εθνικότητες μπορούν να συνυπάρξουν σε ένα έδαφος ή όχι, με ριζικά διαφορετικές συνέπειες. Μια ερμηνεία υποστήριζε την ύπαρξη κυρίαρχης αυτονομίας, συμπεριλαμβανομένου του δικαιώματος απόσχισης, για τις μουσουλμανικής πλειοψηφίας περιοχές της ινδικής υποηπείρου, αλλά χωρίς καμία μεταφορά πληθυσμών (δηλαδή ινδουιστές και μουσουλμάνοι θα συνέχιζαν να ζουν μαζί). Μια διαφορετική ερμηνεία υποστηρίζει ότι οι Ινδουιστές και οι Μουσουλμάνοι αποτελούν "δύο διαφορετικούς και συχνά ανταγωνιστικούς τρόπους ζωής και ότι επομένως δεν μπορούν να συνυπάρξουν σε ένα έθνος". Σύμφωνα με αυτή την εκδοχή, η μεταφορά πληθυσμών (δηλαδή η πλήρης απομάκρυνση των Ινδουιστών από τις περιοχές με μουσουλμανική πλειοψηφία και η πλήρης απομάκρυνση των Μουσουλμάνων από τις περιοχές με ινδουιστική πλειοψηφία) είναι ένα επιθυμητό βήμα προς τον πλήρη διαχωρισμό δύο ασύμβατων εθνών που "δεν μπορούν να συνυπάρξουν σε μια αρμονική σχέση".
Η αντίθεση στη θεωρία προέρχεται από δύο πηγές. Η πρώτη είναι η έννοια του ενιαίου ινδικού έθνους, του οποίου οι Ινδουιστές και οι Μουσουλμάνοι είναι δύο αλληλένδετες κοινότητες. Ακόμη και μετά τη δημιουργία του Πακιστάν, οι συζητήσεις σχετικά με το αν οι μουσουλμάνοι και οι ινδουιστές αποτελούν ή όχι ξεχωριστές εθνότητες συνεχίστηκαν στην Ινδία. Η δεύτερη πηγή αντιδράσεων είναι η αντίληψη ότι, ενώ οι Ινδοί δεν είναι ένα έθνος, ούτε οι Μουσουλμάνοι ή οι Ινδουιστές της υποηπείρου, και ότι, αντίθετα, οι σχετικά ομοιογενείς επαρχιακές μονάδες της υποηπείρου είναι τα πραγματικά έθνη που αξίζουν κυριαρχία- η άποψη αυτή έχει παρουσιαστεί από τις υποεθνικότητες των Βαλούχων, των Σίντι και των Παστούν του Πακιστάν.
