Το Εθνικό Πανεπιστήμιο του San Marcos (ισπανικά: Universidad Nacional Mayor de San Marcos, UNMSM) είναι δημόσιο πανεπιστήμιο στη Λίμα του Περού. Ιδρύθηκε στις 12 Μαΐου 1551. Είναι το πρώτο και σημαντικότερο πανεπιστήμιο του Περού και το παλαιότερο πανεπιστήμιο της αμερικανικής ηπείρου. Το Πανεπιστήμιο San Marcos διαθέτει 20 σχολές και 62 ακαδημαϊκές σχολές. Σε αυτό φοιτούν 28.645 προπτυχιακοί φοιτητές και 3.447 μεταπτυχιακοί φοιτητές. Το Εθνικό Πανεπιστήμιο του San Marcos έχει πολλούς αξιόλογους φοιτητές και αποφοίτους, συμπεριλαμβανομένου του μοναδικού Περουβιανού νομπελίστα, Mario Vargas Llosa. Από ακαδημαϊκής άποψης, το Πανεπιστήμιο του San Marcos κατατάσσεται πρώτο στο Περού.