Ο Simon van der Meer ήταν ένα από τα τέσσερα παιδιά του. Μεγάλωσε στη Χάγη των Κάτω Χωρών. Ο πατέρας του ήταν δάσκαλος και η μητέρα του καταγόταν από οικογένεια δασκάλων. Πήγε σχολείο στο γυμνάσιο της πόλης. Αποφοίτησε το 1943, όταν ο γερμανικός στρατός είχε τον έλεγχο των Κάτω Χωρών. Το 1945, ο van der Meer πήγε στο Τεχνολογικό Πανεπιστήμιο του Delft. Πήρε εκεί το πτυχίο του μηχανικού το 1952. Εντάχθηκε στο CERN το 1956 και παρέμεινε εκεί μέχρι τη συνταξιοδότησή του το 1990.
Το 1966, όταν ο van der Meer έκανε σκι με τους φίλους του στα ελβετικά βουνά, γνώρισε την Catharina M. Koopman, η οποία έγινε σύζυγός του. Απέκτησαν δύο παιδιά - την Esther (γεννηθείσα το 1968) και τον Mathijs (γεννηθείσα το 1970).
Επιστημονική εργασία
Αφού πήρε το πτυχίο του μηχανικού το 1952, ο Simon van der Meer εργάστηκε στο ερευνητικό εργαστήριο της Philips στο Eindhoven. Όταν ήταν εκεί, εργαζόταν κυρίως σε εξοπλισμό υψηλής τάσης και ηλεκτρονικά για ηλεκτρονικά μικροσκόπια. Το 1956, μετακόμισε στο CERN, το οποίο ήταν καινούργιο εκείνη την εποχή. Όταν πρωτοξεκίνησε στο CERN, η εργασία του αφορούσε κυρίως τον τεχνικό σχεδιασμό, και τα τροφοδοτικά. Ενώ εργαζόταν στο CERN, επινόησε την ιδέα της στοχαστικής ψύξης, η οποία οδήγησε στην ανακάλυψη των μποζονίων W και Z. Το 1984, ο van der Meer και ο Carlo Rubbia κέρδισαν το Βραβείο Νόμπελ Φυσικής για το έργο τους με το πρόγραμμα.