Το Ομοσπονδιακό Υπουργείο Ενδογερμανικών Σχέσεων (γερμανικά: Bundesministium für innerdeutsche Beziehungen) ήταν ομοσπονδιακό υπουργείο της Ομοσπονδιακής Δημοκρατίας της Γερμανίας. Ήταν αρμόδιο για όλες τις σχέσεις με την κυβέρνηση της Ανατολικής Γερμανίας. Αυτό συνέβαινε επειδή η δυτικογερμανική κυβέρνηση έλεγε ότι θα έπρεπε να υπάρχει μόνο μία Γερμανία. Αυτό σήμαινε ότι δεν μπορούσαν να χρησιμοποιήσουν το Υπουργείο Εξωτερικών, επειδή δεν μπορούσαν να παραδεχτούν ότι η Ανατολική Γερμανία ήταν μια ξένη χώρα.

Το υπουργείο δημιουργήθηκε το 1949 ως Ομοσπονδιακό Υπουργείο για τις παγγερμανικές υποθέσεις (γερμανικά: Bundesministerium für Gesamtdeutsche Fragen). Το υπουργείο αυτό ήταν επίσης αρμόδιο για θέματα σχετικά με τα γερμανικά εδάφη ανατολικά της γραμμής Όντερ-Νάιτσε, τα οποία είχαν γίνει μέρος της Πολωνίας. Το υπουργείο μετονομάστηκε το 1969, όταν ο Βίλι Μπραντ υπέγραψε συνθήκη με την Πολωνία, η οποία ανέφερε ότι τα δυτικά σύνορα της Πολωνίας ήταν κατά μήκος των ποταμών Όντερ και Νέις. Αυτό ήταν μέρος των ιδεών του Βίλι Μπραντ για την Ostpolitik. Εκείνη την εποχή η Πολωνία βρισκόταν υπό κομμουνιστική κυβέρνηση. Δεν μπορούσαν να επιτρέψουν στη Δυτική Γερμανία να υπογράψει μια συνθήκη για τα σύνορα της Ανατολικής Γερμανίας, γι' αυτό και η συνθήκη αναφέρει "τα δυτικά σύνορα της Πολωνίας" και όχι "τα σύνορα μεταξύ Γερμανίας και Πολωνίας".

Το υπουργείο καταργήθηκε το 1991, περίπου ένα χρόνο μετά την επανένωση της Γερμανίας, αφού βοήθησε στην αλλαγή σε μια χώρα. Όλες οι "ενδογερμανικές υποθέσεις" αποτελούν πλέον εργασίες του Υπουργείου Εσωτερικών. Ο υπουργός Εσωτερικών είναι τώρα επίσης Επίτροπος για τα νέα ομόσπονδα κρατίδια, για να δείξει ότι υπάρχει ακόμα δουλειά για να γίνουν όλα τα κρατίδια ίσα.