Το Metroid Prime Hunters είναι ένα βιντεοπαιχνίδι περιπέτειας δράσης πρώτου προσώπου για την κονσόλα Nintendo DS. Αναπτύχθηκε από την Nintendo Software Technology και δημοσιεύθηκε από τη Nintendo. Κυκλοφόρησε στη Βόρεια Αμερική στις 20 Μαρτίου 2006, στην Ευρώπη στις 5 Μαΐου 2006 και στην Ιαπωνία την 1η Ιουνίου 2006. Όταν το Nintendo DS κυκλοφόρησε το 2004, περιελάμβανε ένα πρώιμο demo του Metroid Prime Hunters, το οποίο τότε είχε τον τίτλο Metroid Prime Hunters: First Hunt.
Όπως και οι άλλοι τίτλοι της σειράς Metroid Prime, το Metroid Prime Hunters είναι ένα παιχνίδι περιπέτειας πρώτου προσώπου, όπου το επίκεντρο είναι η εξερεύνηση και η ανακάλυψη. Ωστόσο, διαφέρει από άλλους τίτλους στο ότι δεν υπάρχει υποβοηθούμενη στόχευση, μεγαλύτερη έμφαση στο gameplay και online multiplayer. Η Samus Aran, ο κύριος χαρακτήρας που υποδύεται ο παίκτης, μπορεί να έχει πρόσβαση στο gunship της από οπουδήποτε. Το παιχνίδι χρησιμοποιεί και τις δύο οθόνες του Nintendo DS: η επάνω οθόνη χρησιμοποιείται για να δείχνει την υγεία της Samus και την ποσότητα ενός όπλου που απομένει, ενώ η κάτω οθόνη δείχνει το ραντάρ. Ο παίκτης κινεί τη Samus με το D-pad, ενώ η σκόπευση γίνεται με τη χρήση της οθόνης αφής στην κάτω οθόνη του Nintendo DS.
Το online multiplayer μπορεί να παιχτεί με έως και τέσσερις παίκτες. Οι παίκτες μπορούν να παίξουν ως Samus ή ως ένας από τους έξι κυνηγούς επικηρυγμένων. Κάθε κυνηγός επικηρυγμένων έχει διαφορετικές μορφές και όπλα. Ο οικοδεσπότης του παιχνιδιού είναι σε θέση να ορίσει επιλογές για πόντους και χρονικά όρια, καθώς και να καθορίσει αν οι παίκτες μπορούν ή όχι να χρησιμοποιήσουν το ραντάρ. Εάν συμμετέχουν σε ένα παιχνίδι λιγότεροι από τέσσερις παίκτες, στο παιχνίδι τοποθετούνται χαρακτήρες που ελέγχονται από υπολογιστή. Στο παιχνίδι πολλαπλών παικτών, στην κάτω οθόνη εμφανίζεται ο αριθμός των σκοτωμών που έχει πραγματοποιήσει ένας παίκτης και ο χρόνος που απομένει στον γύρο.