Τα πρώτα παιχνίδια, που κυκλοφόρησαν το 1998, ήταν τα Pokémon Red και Blue, τα οποία έγιναν μεγάλες επιτυχίες και εξακολουθούν να συγκαταλέγονται στα βιντεοπαιχνίδια με τις μεγαλύτερες πωλήσεις όλων των εποχών. Ακολουθούσαν τις περιπέτειες του παίκτη, ενός εκπαιδευτή Pokémon, ο οποίος πιάνει, μεγαλώνει και μάχεται με Pokémon, συλλέγει σήματα από τους 8 αρχηγούς γυμναστηρίων, εξερευνά όλο το Kanto (την περιοχή) και ανταλλάσσει Pokémon με άλλους ανθρώπους που έχουν το παιχνίδι χρησιμοποιώντας το Game Link Cable του Game Boy. Αργότερα, κυκλοφόρησε μια συνέχεια του Red and Blue: Pokémon Yellow. Σε αυτό το παιχνίδι, ο σχεδιασμός του χαρακτήρα του παίκτη είναι παρόμοιος με τον Ash Ketchum (από το anime.) Επίσης, αντί για τα Pokémon που δίνονται στον παίκτη στην αρχή του Red and Blue (ο παίκτης μπορεί να επιλέξει Bulbasaur, Charmander ή Squirtle) στο Yellow η μόνη δυνατή επιλογή είναι το Pikachu, το οποίο αντιπροσωπεύει το Pokémon με το οποίο ξεκίνησε ο Ash στο anime.
Όταν η Nintendo συνειδητοποίησε πόσο δημοφιλή είχαν γίνει τα Red, Blue και Yellow, αποφάσισε να υποστηρίξει την παραγωγή και την κυκλοφορία περισσότερων παιχνιδιών. Μετά το Κίτρινο ήρθαν τα Pokémon Gold και Silver, που κυκλοφόρησαν το 2000, τα οποία είχαν συνολικά 251 Pokémon που μπορούσαν να πιαστούν, σε αντίθεση με τα 151 που υπήρχαν προηγουμένως. Μια συνέχεια των δύο παιχνιδιών κυκλοφόρησε, το Pokémon Crystal, το οποίο είχε αρκετά νέα χαρακτηριστικά που δεν υπήρχαν στο Gold και Silver: Τα Pokémon είχαν κινούμενα sprites όταν έμπαιναν στη μάχη, υπήρχε μια υποπλοκή μέσα στα παιχνίδια που αφορούσε τα διαφορετικά σχήματα γραμμάτων των Pokémon Unown, και υπήρχε ένα νέο κτίριο που ονομαζόταν Battle Tower, όπου οι παίκτες μπορούσαν να πολεμήσουν πολύ ισχυρά Pokémon για να κερδίσουν αντικείμενα και να κάνουν ρεκόρ. Μόλις ο παίκτης νικήσει την Elite Four, μπορεί να πάει στο Kanto, την περιοχή στο Κόκκινο, το Μπλε και το Κίτρινο.
Το 2003 κυκλοφόρησαν τα Pokémon Ruby και Sapphire. Ήταν τα πρώτα παιχνίδια Pokémon στο Game Boy Advance και αυτό αναστάτωσε πολλούς παίκτες, επειδή δεν μπορούσαν να ανταλλάξουν Pokémon με τα Red, Blue, Yellow, Gold, Silver ή Crystal. Ωστόσο, υπήρχαν 135 νέα Pokémon, ανεβάζοντας το σύνολο σε 386. Υπήρχαν πολλά νέα χαρακτηριστικά, όπως το PokéNav (ένα νέο αντικείμενο που χρησιμοποιείται για πολλές εργασίες μέσα στο παιχνίδι), πολλά περισσότερα είδη Poké Balls, μια πολύ μεγαλύτερη περιοχή (Hoenn) από ό,τι στα προηγούμενα παιχνίδια (Kanto και Johto) και ένας πύργος μάχης διαφορετικός από αυτόν του Crystal. Οι παίκτες μπορούσαν επίσης να δημιουργήσουν Μυστικές Βάσεις, μικρές κρυψώνες κρυμμένες σε δέντρα και βράχους.
Αργότερα, το 2004, κυκλοφόρησαν τα Pokémon Fire Red & Leaf Green. Δεν έλαβαν χώρα σε νέα περιοχή και δεν είχαν νέα Pokémon. Ήταν απλά επανεκδόσεις των Pokémon Red & Blue, προσθέτοντας μια νέα "επιπλέον περιοχή" που ονομαζόταν Sevii Islands και μερικά νέα χαρακτηριστικά. Ωστόσο, έδωσαν τη δυνατότητα στους παίκτες των Ruby και Sapphire να αποκτήσουν παλαιότερα Pokémon στα παιχνίδια τους. Αν κάποιος είχε τα Ruby, Sapphire, Colosseum, FireRed και LeafGreen (κάτι που έκαναν πολλοί οπαδοί των παιχνιδιών), μπορούσε να έχει και τα 386 Pokémon, κάτι που έκανε πολλούς παίκτες χαρούμενους.
Το 2005 κυκλοφόρησε το Pokémon Emerald. Πρόκειται για τη συνέχεια των Ruby και Sapphire. Ήταν το πρώτο "κύριο" παιχνίδι Pokémon μετά το Crystal όπου τα Pokémon είχαν animation μάχης αντί για στατικές εικόνες. Υπήρχε επίσης ένα νέο μέρος που ονομαζόταν Battle Frontier όπου οι παίκτες μπορούσαν να πάνε αφού νικήσουν την Elite Four. Ήταν παρόμοιο με τον Πύργο Μάχης στα Crystal, Ruby και Sapphire, μόνο που ήταν οκτώ διαφορετικές εγκαταστάσεις, όλες με διαφορετικούς κανόνες. Οι παίκτες κέρδιζαν Πόντους Μάχης, τους οποίους μπορούσαν να χρησιμοποιήσουν για να αγοράσουν αντικείμενα για Μυστικές Βάσεις, αντικείμενα για Pokémon και άλλα πράγματα.
Το 2007 κυκλοφόρησαν τα Pokémon Diamond και Pearl. Πραγματοποιούνται σε μια νέα περιοχή που ονομάζεται Sinnoh. Είχαν 107 νέα Pokémon, τα οποία ανέβασαν το σύνολο σε 493. Μια άλλη αξιοσημείωτη διαφορά από τα προηγούμενα παιχνίδια ήταν ότι τα Diamond και Pearl δεν έγραφαν με κεφαλαίο όλα τα γράμματα στα ονόματα των Pokémon, των ανθρώπων, των πόλεων, των αντικειμένων και άλλων πραγμάτων που ήταν σημαντικά για τα παιχνίδια. Για παράδειγμα, ο Lugia εμφανιζόταν ως "LUGIA" στα προηγούμενα παιχνίδια, αλλά στο Diamond and Pearl έλεγε απλά "Lugia". Αυτό έλυσε τη σύγχυση πολλών παικτών, επειδή πολλοί πίστευαν ότι μια πρόταση όπως "Η LUGIA βρίσκεται στα ΝΗΣΙΑ WHIRL" φαινόταν ασυνήθιστη. Η συνέχεια των Diamond και Pearl, το Pokémon Platinum κυκλοφόρησε στις Ηνωμένες Πολιτείες τον Μάρτιο του 2009. Τον Μάιο του 2009 κυκλοφόρησε στο Ηνωμένο Βασίλειο.
Το 2010 κυκλοφόρησαν τα Pokémon HeartGold & SoulSilver. Δεν έλαβαν χώρα σε νέα περιοχή, ούτε είχαν νέα Pokémon. Ήταν απλά επανεκδόσεις των Pokémon Gold και Silver. Όπως και στα Pokémon Yellow, τα Pokémon του παίκτη μπορούν να τους ακολουθήσουν. Τα παιχνίδια συνοδεύονται από μια συσκευή που μοιάζει με βηματόμετρο και ονομάζεται Poké Walker, η οποία επιτρέπει στους παίκτες να περπατούν με τα Pokémon τους και να κερδίζουν Watts, τα οποία μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να πολεμήσουν Pokémon ή να ψάξουν για αντικείμενα.
Αργότερα, το 2010, κυκλοφόρησαν τα Pokémon Black και White. Η δράση τους λαμβάνει χώρα σε μια νέα περιοχή που ονομάζεται Unova. Είχαν 156 νέα Pokémon, ανεβάζοντας το σύνολο σε 649. Εισήγαγαν τις εποχές, όπου οι περιοχές εμφανίζονται διαφορετικά ανάλογα με την εποχή, και ορισμένες περιοχές μπορούν να προσεγγιστούν μόνο κατά τη διάρκεια ορισμένων εποχών.
Το 2012 κυκλοφόρησαν τα Pokémon Black 2 & White 2. Πρόκειται για συνέχειες των Pokémon Black και White. Είχαν πολλές νέες περιοχές και χαρακτήρες, καθώς και χαρακτήρες από το Black και το White.
Το 2013 κυκλοφόρησαν τα Pokémon X & Y. Πρόκειται για τα πρώτα 3D παιχνίδια της κύριας σειράς Pokémon. Πραγματοποιούνται σε μια νέα περιοχή που ονομάζεται Kalos. Υπάρχουν πολλά νέα χαρακτηριστικά, όπως η Mega Evolution, όπου ορισμένα Pokémon όπως τα Mewtwo, Blaziken και Lucario μπορούν να εξελιχθούν σε ισχυρότερες μορφές κατά τη διάρκεια μιας μάχης, αν κρατούν ένα Mega Stone. Υπάρχει επίσης ένας νέος τύπος που ονομάζεται Fairy, ο οποίος είναι ισχυρός ενάντια στα Pokémon τύπου Dragon.
το 2014, κυκλοφόρησαν τα Pokémon Omega Ruby & Alpha Sapphire, τα οποία ήταν remakes των Ruby και Sapphire. προστέθηκαν περισσότερες mega evolutions, συμπεριλαμβανομένων των άλλων hoenn starters, beedrill, Sableye, κ.λπ. προστέθηκαν επίσης τόνοι χαρακτηριστικών.
Το 2016 κυκλοφόρησαν τα Pokémon Sun & Moon, τα οποία εισήγαγαν τους ανθρώπους σε μια νέα περιοχή, την Alola. υπήρχαν συνολικά 803 (συμπεριλαμβανομένων των mythical's). ωστόσο, μόνο 403 βρίσκονται στο pokedex της Alolan, με τα υπόλοιπα να μπορούν να μεταφερθούν από προηγούμενα παιχνίδια. το rotom είναι πλέον το pokedex σας, που ονομάζεται rotomdex, και εισήχθησαν οι κινήσεις z. οι κινήσεις z κάνουν μεγάλη ζημιά,αλλά μπορούν να γίνουν μόνο μια φορά ανά μάχη. τα γυμναστήρια και οι αρχηγοί γυμναστηρίων αφαιρέθηκαν, και αντικαταστάθηκαν από τα pokemon τοτέμ, και τα island kahunas. προστέθηκαν πολλά χαρακτηριστικά, όπως οι μάχες SOS, όπου ένα άγριο Pokémon στέλνει βοήθεια σε ακριβώς το ίδιο Pokémon (ή evolutions) για να βοηθήσει όταν αποδυναμωθεί.
Το 2017 κυκλοφόρησαν τα Pokémon Ultra Sun & Ultra Moon, τα οποία ήταν σαν το Sun & Moon, αλλά προστέθηκαν περισσότερες λειτουργίες.Αυξήθηκε ο αριθμός των Pokémon σε 807 και προστέθηκαν ultra wormholes, όπου βλέπεις και πιάνεις διαφορετικά Pokémon, γεγονός που έκανε το κυνήγι γυαλιστερών πολύ εύκολο και προσιτό.
