Sir Joseph John "J.J." Thomson, OM, FRS (18 Δεκεμβρίου 1856 - 30 Αυγούστου 1940) ήταν Βρετανός φυσικός και βραβευμένος με Νόμπελ. Ανακάλυψε το ηλεκτρόνιο και τα ισότοπα και εφηύρε το φασματόμετρο μάζας. Του απονεμήθηκε το βραβείο Νόμπελ Φυσικής το 1906 για την ανακάλυψη του ηλεκτρονίου και το έργο του σχετικά με την αγωγή του ηλεκτρισμού στα αέρια. Ο Τζον Τζόζεφ Τόμσον το 1893 δήλωσε: "Ο Τζον Τζόζεφ Τόμσον είναι ο πρώτος άνθρωπος που έχει την ικανότητα να παράγει ηλεκτρόνια: "Δεν υπάρχει άλλος κλάδος της φυσικής που να μας παρέχει μια τόσο ελπιδοφόρα ευκαιρία να διεισδύσουμε στο μυστικό του ηλεκτρισμού".

Το 1897, ο Thomson έδειξε ότι οι καθοδικές ακτίνες αποτελούνται από ένα άγνωστο μέχρι τότε αρνητικά φορτισμένο σωματίδιο με πολύ μικρή μάζα σε σύγκριση με το ηλεκτρικό του φορτίο. Αργότερα ονομάστηκε ηλεκτρόνιο και ήταν το πρώτο υποατομικόσωματίδιο που βρέθηκε. Ο Thomson βρήκε επίσης την πρώτη ένδειξη για ισότοπα ενός σταθερού (μη ραδιενεργού) στοιχείου το 1913, ενώ μελετούσε τις ανοδικές ακτίνες (θετικά κατιόντα).

Στην ατομική θεωρία υπέθεσε ότι τα άτομα ήταν σφαίρες ομοιόμορφα κατανεμημένου θετικού φορτίου, όπου βρισκόταν ένα μεμονωμένο αρνητικά φορτισμένο ηλεκτρόνιο. Αργότερα κατέληξε στο συμπέρασμα ότι υπήρχαν περισσότερα από ένα αρνητικά φορτισμένα σωματίδια σε ένα άτομο.

Πολλοί από τους νέους που σπούδασαν και εργάστηκαν μαζί του στο Πανεπιστήμιο του Κέιμπριτζ έγιναν επίσης διάσημοι φυσικοί.