Η εναλλακτική ωρίμανση επιτρέπει στο DNA να κωδικοποιεί περισσότερες από μία πρωτεΐνες. Μεταβάλλει τη σύνθεση των εξονίων του αγγελιοφόρου RNA.
Στην εναλλακτική ωρίμανση τα εξώνια του προ-μεσογειακού RNA που παράγεται από τη μεταγραφή επανασυνδέονται με διαφορετικούς τρόπους κατά τη διάρκεια της ωρίμανσης του RNA.
Αυτό παράγει διαφορετικά ώριμα αγγελιοφόρα RNA από το ίδιο γονίδιο. Μεταφράζονται σε διαφορετικές πρωτεΐνες. Έτσι, ένα και μόνο γονίδιο μπορεί να κωδικοποιεί πολλαπλές πρωτεΐνες.
Η εναλλακτική ωρίμανση είναι φυσιολογική στους ευκαρυώτες. Αυξάνει σημαντικά την ποικιλομορφία των πρωτεϊνών που μπορούν να κωδικοποιηθούν από το γονιδίωμα. Στον άνθρωπο, το ~95% των πολυεξονικών γονιδίων είναι εναλλακτικά ματσωμένα.
Υπάρχουν διάφορα είδη εναλλακτικής συγκόλλησης: το πιο συνηθισμένο είναι η παράλειψη εξονίου. Ένα εξώνιο μπορεί να περιλαμβάνεται στα mRNA υπό ορισμένες συνθήκες ή σε συγκεκριμένους ιστούς και να παραλείπεται από το mRNA σε άλλους. Υπάρχουν ενεργοποιητές ωρίμανσης που προωθούν τη χρήση μιας συγκεκριμένης θέσης ωρίμανσης και καταστολείς ωρίμανσης που μειώνουν τη χρήση μιας συγκεκριμένης θέσης. Βρίσκονται νέοι τύποι εναλλακτικής ωρίμανσης.
Ανώμαλες παραλλαγές στο μάτισμα εμφανίζονται σε ασθένειες. Πολλές ανθρώπινες γενετικές διαταραχές οφείλονται σε παραλλαγές ματίσματος. Οι ανώμαλες παραλλαγές μάτισμα μπορεί επίσης να συμβάλλουν στην ανάπτυξη καρκίνου. Τα μη λειτουργικά προϊόντα ωρίμανσης αντιμετωπίζονται συνήθως με μετα-μεταγραφικό έλεγχο ποιότητας. Δηλαδή, τεμαχίζονται από ένζυμα.
