Το Πανεπιστήμιο του Ζάγκρεμπ (κροατικά: Sveučilište u Zagrebu, προφέρεται [sʋeǔt͡ʃiliːʃte u zǎːgrebu], λατινικά: Universitas Studiorum Zagrabiensis) είναι το μεγαλύτερο κροατικό πανεπιστήμιο και το παλαιότερο πανεπιστήμιο που λειτουργεί συνεχώς στην περιοχή που καλύπτει την Κεντρική Ευρώπη νότια της Βιέννης και όλη τη Νοτιοανατολική Ευρώπη.

Η ιστορία του Πανεπιστημίου ξεκίνησε στις 23 Σεπτεμβρίου 1669, όταν ο Αυτοκράτορας της Αγίας Ρωμαϊκής Αυτοκρατορίας Λεοπόλδος Α' εξέδωσε διάταγμα με το οποίο παραχωρήθηκε η ίδρυση της Ακαδημίας Ιησουιτών της Βασιλικής Ελεύθερης Πόλης του Ζάγκρεμπ. Το διάταγμα έγινε δεκτό στο Συμβούλιο του Κροατικού Βασιλείου στις 3 Νοεμβρίου 1671. Η Ακαδημία διοικούνταν από τους Ιησουίτες για περισσότερο από έναν αιώνα, έως ότου το τάγμα διαλύθηκε από τον Πάπα Κλήμη ΙΔ' το 1773. Το 1776, η αυτοκράτειρα Μαρία Θηρεσία εξέδωσε διάταγμα για την ίδρυση της Βασιλικής Ακαδημίας Επιστημών, η οποία διαδέχθηκε την προηγούμενη Ακαδημία των Ιησουιτών. Ο επίσκοπος Josip Juraj Strossmayer πρότεινε την ίδρυση Πανεπιστημίου στο κροατικό κοινοβούλιο το 1861. Ο αυτοκράτορας Φραγκίσκος Ιωσήφ υπέγραψε το διάταγμα για την ίδρυση του Πανεπιστημίου του Ζάγκρεμπ το 1869. Ο ιδρυτικός νόμος ψηφίστηκε από το Κοινοβούλιο το 1874 και επικυρώθηκε από τον αυτοκράτορα στις 5 Ιανουαρίου 1874. Στις 19 Οκτωβρίου 1874 εγκαινιάστηκε επίσημα το Βασιλικό Πανεπιστήμιο του Φραγκίσκου Ιωσήφ Α΄.

Το Πανεπιστήμιο αποτελείται από 29 σχολές, 3 ακαδημίες τέχνης και 1 πανεπιστημιακό κέντρο με περισσότερους από 70.000 φοιτητές. Το Πανεπιστήμιο βρίσκεται από το 2018 στην 463η θέση από τα 1000 στον κατάλογο των πανεπιστημίων του κόσμου που συντάχθηκε από το Center for University World Rankings.