Το Lecompton ιδρύθηκε το 1854 σε ένα βράχο στη νότια πλευρά του ποταμού Κάνσας. Αρχικά, το όνομα της πόλης ήταν "Bald Eagle", αλλά το όνομα άλλαξε σε Lecompton προς τιμήν του Samuel Lecompte, του αρχιδικαστή του ανώτατου εδαφικού δικαστηρίου. Την άνοιξη του 1855, η πόλη έγινε η πρωτεύουσα της Επικράτειας του Κάνσας. Ο πρόεδρος Τζέιμς Μπιουκάναν επέλεξε έναν κυβερνήτη και αξιωματούχους για τη δημιουργία κυβερνητικών γραφείων στο Λέκομπτον. Το πρώτο ταχυδρομείο στο Λέκομπτον δημιουργήθηκε τον Σεπτέμβριο του 1855.
Το φθινόπωρο του 1857 συνήλθε ένα συνέδριο στο Constitution Hall. Συνέταξαν το περίφημο Σύνταγμα του Λέκομπτον, το οποίο θα έκανε το Κάνσας να γίνει δουλοκτητική πολιτεία. Το σύνταγμα απορρίφθηκε μετά από οργισμένη εθνική συζήτηση και αποτέλεσε μια από τις βασικές ιδέες των συζητήσεων Λίνκολν-Ντούγκλας. Η διαμάχη προστέθηκε στην αυξανόμενη μάχη που εξελίχθηκε στον εμφύλιο πόλεμο. Το Σύνταγμα του Λέκομπτον απέτυχε, εν μέρει, επειδή οι αντιδουλικοί είχαν τον έλεγχο του εδαφικού νομοθετικού σώματος στις εκλογές του 1857. Το νέο νομοθετικό σώμα συνήλθε στο Constitution Hall και άρχισε γρήγορα να καταργεί τους νόμους υπέρ της δουλείας.
Οι ελεύθεροι υποστηρικτές προσπάθησαν σύντομα να μεταφέρουν την πρωτεύουσα της επικράτειας στη Μιννέολα, στην κομητεία Φράνκλιν του Κάνσας, μέσω ψηφοφορίας, αλλά το νομοσχέδιο που προέκυψε απορρίφθηκε αργότερα από τον κυβερνήτη της επικράτειας του Κάνσας Τζέιμς Γ. Ντένβερ και κατέστη άκυρο από τον Τζερεμάια Σ. Μπλακ, Γενικό Εισαγγελέα των Ηνωμένων Πολιτειών. Ως εκ τούτου, το Λέκομπτον παρέμεινε η de jure πρωτεύουσα της επικράτειας. Αυτό συνέβη μέχρι που η Τοπίκα έγινε πρωτεύουσα όταν το Κάνσας έγινε πολιτεία στις 29 Ιανουαρίου 1861. Ο αμερικανικός εμφύλιος πόλεμος ξεκίνησε στις 12 Απριλίου 1861.