Μια κυψέλη καυσίμου παράγει ηλεκτρική ενέργεια χρησιμοποιώντας την ενέργεια που απελευθερώνεται από την ανάμιξη καυσίμου με αέρα, μια αντίδραση που δημιουργεί νερό και μερικές φορές επίσης διοξείδιο του άνθρακα. Το πιο συνηθισμένο καύσιμο για τις κυψέλες καυσίμου είναι το υδρογόνο, το οποίο όταν αντιδρά με το οξυγόνο του αέρα παράγει μόνο νερό. Οι κυψέλες καυσίμου λειτουργούν όπως μια μπαταρία που τροφοδοτείται συνεχώς με καύσιμο, ώστε να μην αδειάζει ποτέ (εφόσον έχετε αρκετό καύσιμο). Οι κυψέλες καυσίμου αποτελούν σημαντικό μέρος της οικονομίας του υδρογόνου. Μόρια υδρογόνου βρίσκονται σε ουσίες όπως το μεθάνιο, το νερό και η βιομάζα, αλλά σε όλες τις περιπτώσεις απαιτείται κάποια ενέργεια για την εξαγωγή του. Υπάρχουν δύο συνήθεις τρόποι για την παραγωγή υδρογόνου - μπορεί να διαχωριστεί από τα περισσότερα καύσιμα όπως το πετρέλαιο, το φυσικό αέριο, ο άνθρακας σε μια διαδικασία που ονομάζεται αναμόρφωση με ατμό, ή μπορεί να εξαχθεί από το νερό χρησιμοποιώντας μια διαδικασία που ονομάζεται ηλεκτρόλυση. Εάν το υδρογόνο διαχωρίζεται από τα ορυκτά καύσιμα, απελευθερώνεται διοξείδιο του άνθρακα. Εάν η ενέργεια που χρησιμοποιείται για την εξαγωγή του από το νερό μέσω ηλεκτρόλυσης προέρχεται από την ηλιακή ή την αιολική ενέργεια, τότε το παραγόμενο υδρογόνο είναι καλοήθες επειδή δεν εκλύονται εκπομπές. Το υδρογόνο μπορεί επίσης να διαχωριστεί από ανανεώσιμο βιοαέριο, πράγμα που σημαίνει ότι ο εκπεμπόμενος άνθρακας δεν είναι ορυκτής προέλευσης και επομένως αποτελεί μέρος του φυσικού κύκλου του άνθρακα.