Η κυστεΐνη (συντομογραφία Cys ή C) είναι ένα α-αμινοξύ. Έχει τον χημικό τύπο HO2 CCH(NH2 )CH2 SH.

Η κυστεΐνη είναι ένα ημι-βασικό αμινοξύ, που σημαίνει ότι ο άνθρωπος μπορεί να την παράγει. Τα κωδικόνια UGU και UGC κωδικοποιούν την κυστεΐνη. Η πλευρική αλυσίδα της θειόλης στην κυστεΐνη κάνει συχνά ενζυμικές αντιδράσεις ως πυρηνόφιλο. Η θειόλη οξειδώνεται για να δώσει το δισουλφιδικό παράγωγο της κυστίνης, το οποίο είναι σημαντικό σε πολλές πρωτεϊνικές δομές. Όταν χρησιμοποιείται ως πρόσθετο τροφίμων, η κυστεΐνη έχει τον αριθμό Ε920.