Ο Johannes Peter Müller (14 Ιουλίου 1801 - 28 Απριλίου 1858), ήταν Γερμανός φυσιολόγος, συγκριτικός ανατόμος, ιχθυολόγος και ερπετολόγος. Το 1833 έγινε καθηγητής φυσιολογίας στο Πανεπιστήμιο του Βερολίνου.

Στο μεταγενέστερο μέρος της ζωής του αφιερώθηκε κυρίως στη συγκριτική ανατομία. Τα ψάρια και τα θαλάσσια ασπόνδυλα ήταν τα αγαπημένα του θέματα. Πραγματοποίησε 19 ταξίδια στη Βαλτική και τη Βόρεια Θάλασσα, την Αδριατική και τη Μεσόγειο για να διερευνήσει τη ζωή στο αλμυρό νερό.

Συνέγραψε ένα ολοκληρωμένο έργο για την ανατομία των αμφιβίων, τα οποία στην εποχή του περιελάμβαναν και τα ερπετά. Επίσης, περιέγραψε αρκετά νέα είδη φιδιών.

Ο Müller υπήρξε μέντορας ορισμένων διακεκριμένων φυσιολόγων και βιολόγων, όπως οι Hermann von Helmholtz, Emil du Bois-Reymond, Theodor Schwann, Friedrich Gustav Jakob Henle, Carl Ludwig και Ernst Haeckel. Το 1834 εξελέγη ξένο μέλος της Βασιλικής Σουηδικής Ακαδημίας Επιστημών. Του απονεμήθηκε το μετάλλιο Copley της Βασιλικής Εταιρείας το 1854.