Carsonella ruddii

Συγγραφέας: Leandro Alegsa

09-04-3647

Το Candidatus Carsonella ruddii είναι ένα ενδοσυμβιωτικό γ-πρωτεοβακτήριο. Έχει το μικρότερο γνωστό γονιδίωμα από όλα τα βακτήρια.

Το είδος είναι ένα ενδοσύμβιο που υπάρχει σε όλα τα είδη εντόμων που τρέφονται με χυμούς φλοιοσπόρου και είναι γνωστά ως ψυλλίδες. Το ενδοσύμβιο εμφανίζεται σε μια εξειδικευμένη δομή γνωστή ως βακτηρίδιο.

Το 2006 το γονιδίωμα ενός στελέχους του Ca. C. ruddi αλληλουχήθηκε στο RIKEN στην Ιαπωνία και στο Πανεπιστήμιο της Αριζόνα. Το γονιδίωμα είναι ένα κυκλικό χρωμόσωμα 159.662 ζευγών βάσεων και έχει υψηλή πυκνότητα κωδικοποίησης (97%) με πολλά επικαλυπτόμενα γονίδια και μειωμένο μήκος γονιδίων. Ο αριθμός των προβλεπόμενων γονιδίων ήταν 182, επίσης ο χαμηλότερος που έχει καταγραφεί (NCBI-Genome). Πολυάριθμα γονίδια που θεωρούνται απαραίτητα για τη ζωή φαίνεται να λείπουν, γεγονός που υποδηλώνει ότι το είδος μπορεί να έχει αποκτήσει καθεστώς οργανιδίου.

Συγκριτικά, το Mycoplasma genitalium, το οποίο έχει το μικρότερο γονιδίωμα από κάθε ελεύθερο οργανισμό, έχει γονιδίωμα 521 γονιδίων.

Ερωτήσεις και απαντήσεις

Q: Τι είναι το Candidatus Carsonella ruddii;

A: Το Candidatus Carsonella ruddii είναι ένα ενδοσυμβιωτικό γ-πρωτεοβακτήριο που υπάρχει σε όλα τα είδη εντόμων που τρέφονται με χυμούς φλοιοσπορίου, γνωστά ως ψιλοίδες.

Ερ: Ποιο είναι το μέγεθος του γονιδιώματος του Candidatus Carsonella ruddii;

Α: Το γονιδίωμα του Candidatus Carsonella ruddii είναι το μικρότερο γνωστό γονιδίωμα οποιουδήποτε βακτηρίου και είναι ένα κυκλικό χρωμόσωμα 159.662 ζευγών βάσεων.

Ερ: Πόσα γονίδια προβλέπεται να υπάρχουν στο Candidatus Carsonella ruddii;

Α: Ο αριθμός των προβλεπόμενων γονιδίων στο Candidatus Carsonella ruddii είναι 182, ο οποίος είναι ο χαμηλότερος που έχει καταγραφεί (NCBI-Genome).

Ερ: Ποια είναι η πυκνότητα κωδικοποίησης του γονιδιώματος του Candidatus Carsonella ruddii;

Α: Το γονιδίωμα του Candidatus Carsonella ruddii έχει υψηλή πυκνότητα κωδικοποίησης 97%.

Ερ: Τι είναι το βακτηριόμορφο;

Α: Το βακτηρίωμα είναι μια εξειδικευμένη δομή όπου εμφανίζονται τα ενδοσυμβιόντα στο Candidatus Carsonella ruddii.

Ερ: Τι λείπει από το γονιδίωμα του Candidatus Carsonella ruddii;

Α: Πολλά γονίδια που θεωρούνται απαραίτητα για τη ζωή φαίνεται να λείπουν από το γονιδίωμα του Candidatus Carsonella ruddii, γεγονός που υποδηλώνει ότι το είδος μπορεί να έχει αποκτήσει οργανική κατάσταση.

Ερ: Πώς συγκρίνεται το γονιδίωμα του Candidatus Carsonella ruddii με εκείνο του Mycoplasma genitalium;

Α: Το γονιδίωμα του Mycoplasma genitalium, το οποίο έχει το μικρότερο γονιδίωμα από οποιονδήποτε οργανισμό που ζει ελεύθερα, έχει 521 γονίδια, τα οποία είναι σημαντικά περισσότερα από τον αριθμό των προβλεπόμενων γονιδίων στο Candidatus Carsonella ruddii.