Γονιδίωμα
Το γονιδίωμα ενός οργανισμού είναι το σύνολο των κληρονομικών πληροφοριών του που είναι κωδικοποιημένες στο DNA του (ή, για ορισμένους ιούς, στο RNA). Αυτό περιλαμβάνει τόσο τα γονίδια όσο και τις μη κωδικοποιητικές αλληλουχίες του DNA. Ο καθηγητής Hans Winkler επινόησε τον όρο το 1920.
Ο ορισμός του Winkler, σε μετάφραση, έχει ως εξής:
"Προτείνω την έκφραση γονιδίωμα για το σύνολο των απλοειδών χρωμοσωμάτων, το οποίο, μαζί με το σχετικό πρωτόπλασμα, καθορίζει τα υλικά θεμέλια του είδους ...." p165
Ωστόσο, κανένα ενιαίο σύνολο απλοειδών χρωμοσωμάτων δεν καθορίζει ακόμη και το DNA ενός είδους. Λόγω της τεράστιας ποικιλίας των αλληλόμορφων που φέρει ένας πληθυσμός, κάθε άτομο είναι γενετικά διαφορετικό. Ακόμη και ένα διπλοειδές άτομο φέρει γενετική ποικιλία. Για το λόγο αυτό ο Dobzhansky προτίμησε το "σύνολο χρωμοσωμάτων", και ο ορισμός πρέπει τώρα να είναι ευρύτερος από τον ορισμό του Winklers. Το γονιδίωμα ενός απλοειδούς συνόλου χρωμοσωμάτων είναι απλώς ένα δείγμα της συνολικής γενετικής ποικιλίας ενός είδους.
Ο όρος "γονιδίωμα" μπορεί να χρησιμοποιηθεί ειδικά για να υποδηλώσει το πλήρες σύνολο του πυρηνικού DNA (το "πυρηνικό γονιδίωμα"), αλλά μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για τα οργανίδια που περιέχουν το δικό τους DNA, όπως το μιτοχονδριακό γονιδίωμα ή το γονιδίωμα του χλωροπλάστη.
Μεγέθη γονιδιώματος
| Οργανισμός | Μέγεθος γονιδιώματος (ζεύγη βάσεων) | Σημείωση |
| Ιός, Βακτηριοφάγος MS2 | 3569 | Πρώτη αλληλουχία RNA-γονιδιώματος |
| Ιός, SV40 | 5224 | |
| Ιός, Φάγος Φ-X174 | 5386 | Πρώτη αλληλουχία DNA-γονιδιώματος |
| Ιός, Φάγος λ | 5×10 4 | |
| 1.6×10 5 | Το μικρότερο μη-ιικό γονιδίωμα, Φεβρουάριος 2007 | |
| Βακτήριο, Escherichia coli | 4×10 6 | Το καλύτερα ερευνημένο βακτήριο. |
| Βακτήριο, Solibactoer usitatus | 1×10 7 | Το μεγαλύτερο γνωστό βακτηριακό γονιδίωμα |
| Πρωτίστας, Amoeba dubia | 6.7×10 11 | Το μεγαλύτερο γνωστό γονιδίωμα, αλλά αμφισβητείται. |
| Φυτό, Arabidopsis thaliana | 1.57×10 8 | Το πρώτο φυτικό γονιδίωμα αλληλουχήθηκε, Δεκέμβριος 2000. |
| Φυτό, Genlisea margaretae | 6.34×10 7 | Το μικρότερο καταγεγραμμένο γονιδίωμα ανθοφόρου φυτού, 2006. |
| Φυτό, Fritillaria assyrica | 1.3×10 11 | |
| Φυτό, Populus trichocarpa | 4.8×10 8 | Πρώτο γονιδίωμα δέντρου, Σεπτέμβριος 2006 |
| Μαγιά, Saccharomyces cerevisiae | 2×10 7 | |
| Μύκητας, Aspergillus nidulans | 3×10 7 | |
| Νηματώδης, Caenorhabditis elegans | 9.8×10 7 | Το πρώτο πολυκύτταρο γονιδίωμα ζώου, Δεκέμβριος 1998. |
| Έντομο, Drosophila melanogaster ή αλλιώς μύγα των φρούτων | 1.3×10 8 | |
| Έντομο, Bombyx mori ή αλλιώς μεταξοσκώρος | 5.30×10 8 | |
| Έντομο, Apis mellifera ή αλλιώς μέλισσα | 1.77×10 9 | |
| Ψάρι, Tetraodon nigroviridis, είδος Puffer fish | 3.85×10 8 | Το μικρότερο γνωστό γονιδίωμα σπονδυλωτών |
| 3×10 9 | ||
| Ψάρι, Protopterus aethiopicus ή αλλιώς μαρμαρωμένο πνευμόνι | 1.3×10 11 | Το μεγαλύτερο γνωστό γονιδίωμα σπονδυλωτών |
Σημείωση: Το DNA από ένα μόνο ανθρώπινο κύτταρο έχει μήκος ~1,8 m (αλλά με πλάτος ~2,4 νανόμετρα).
Σχετικές σελίδες
- Gene
- Ανάλυση αλληλουχίας
- Ανθρώπινο γονιδίωμα
- ENCODE: η πλήρης ανάλυση του ανθρώπινου γονιδιώματος
Ερωτήσεις και απαντήσεις
Ε: Τι είναι το γονιδίωμα;
A: Γονιδίωμα είναι το σύνολο των κληρονομικών πληροφοριών ενός οργανισμού που κωδικοποιούνται στο DNA του (ή, για ορισμένους ιούς, στο RNA). Αυτό περιλαμβάνει τόσο τα γονίδια όσο και τις μη κωδικοποιητικές αλληλουχίες του DNA.
Ερ: Ποιος επινόησε τον όρο "γονιδίωμα";
Α: Ο καθηγητής Hans Winkler επινόησε τον όρο "γονιδίωμα" το 1920.
Ερ: Τι όρισε ο Winkler ως γονιδίωμα;
Α: Ο Winkler όρισε το γονιδίωμα ως "το απλοειδές σύνολο χρωμοσωμάτων, το οποίο, μαζί με το σχετικό πρωτόπλασμα, καθορίζει τα υλικά θεμέλια του είδους".
Ερ: Κάθε άτομο έχει γενετική ποικιλία;
Α: Ναι, λόγω των αλληλόμορφων που φέρει ένας πληθυσμός, κάθε άτομο είναι γενετικά διαφορετικό. Ακόμη και τα διπλοειδή άτομα φέρουν γενετική ποικιλία.
Ερ: Τι σημαίνει όταν λέμε "πυρηνικό γονιδίωμα";
Α: Όταν αναφερόμαστε στο "πυρηνικό γονιδίωμα", εννοούμε συγκεκριμένα το πλήρες σύνολο του πυρηνικού DNA.
Ερ: Υπάρχουν και άλλα γονιδιώματα εκτός από τα πυρηνικά γονιδιώματα;
Α: Ναι, υπάρχουν επίσης μιτοχονδριακά γονιδιώματα και χλωροπλαστικά γονιδιώματα που περιέχουν το δικό τους DNA.
