Τα κύτταρα ανακαλύφθηκαν από τον Robert Hooke (1635-1703). Χρησιμοποίησε ένα σύνθετο μικροσκόπιο με δύο φακούς για να εξετάσει τη δομή του φελλού, καθώς και φύλλα και ορισμένα έντομα. Το έκανε αυτό από το 1660 περίπου και το ανέφερε στο βιβλίο του Micrographica το 1665. Ονόμασε τα κύτταρα από τη λατινική λέξη cella, που σημαίνει δωμάτιο. Το έκανε αυτό επειδή πίστευε ότι τα κύτταρα έμοιαζαν με μικρά δωμάτια.
Πολλοί άλλοι φυσιοδίφες και φιλόσοφοι δοκίμασαν το νέο όργανο. Η δομή των φυτών διερευνήθηκε από τον Nehemiah Grew (1641-1712) και τον Marcello Malpighi (1628-1694). Το σημαντικότερο έργο του Grew ήταν η Ανατομία των φυτών (1682). Δεν είναι σαφές ποιος είδε πρώτος τα ζωικά κύτταρα, ο Malpighi, ο Jan Swammerdam (1637-1680) ή ο Antonie van Leeuwenhoek (1632-1723). . p17
Οι ανακαλύψεις του Leeuwenhoek και τα σχέδια των "μικρών ζώων" άνοιξαν έναν εντελώς νέο κόσμο για τους φυσιοδίφες. Ανακαλύφθηκαν τα πρωτόζωα και γενικά οι μικροοργανισμοί, και οι ανακαλύψεις γι' αυτά συνεχίζονται ακόμη και σήμερα. Το βιβλίο του Christian Gottfried Ehrenberg Die Infusionsthierchen συνοψίζει τα όσα ήταν γνωστά το 1838. Ο Lorenz Oken (1779-1851) το 1805 έγραψε ότι τα infusoria (μικροσκοπικές μορφές) ήταν η βάση κάθε ζωής.
Η ιδέα ότι τα κύτταρα αποτελούν τη βάση των μεγαλύτερων μορφών ζωής ήρθε τον 18ο αιώνα. Το να βρεθεί ποιος έκανε τη δουλειά χρειάστηκε αρκετό χρόνο:
"Το έργο του Τσέχου Jan Purkyně (1787-1869) και του μαθητή και συνεργάτη του Gabriel Valentin (1810-1883) δυσφημίστηκε άδικα από τους εθνικιστές Γερμανούς. Έχουν αξίωση για κάποια προτεραιότητα στη θεωρία των κυττάρων". Κεφάλαιο 9 Ο Johannes Müller (1801-1858) είχε επίσης μεγάλη συμβολή. "Ήταν, ωστόσο, ο μαθητής του Theodor Schwann (1810-1882) και ο Matthias Schleiden (1804-1881) που πήραν τα εύσημα για την κυτταρική θεωρία, παρά το γεγονός ότι ορισμένες από τις παρατηρήσεις τους δεν ήταν σωστές και οι αναφορές τους σε προηγούμενους εργάτες ήταν "παρωδία".p97
Η θεωρία των κυττάρων περιλαμβάνει αυτές τις σημαντικές ιδέες:
- Όλα τα έμβια όντα αποτελούνται από κύτταρα.
- Το κύτταρο είναι η βασική μονάδα δομής και λειτουργίας όλων των οργανισμών.
- Κάθε κύτταρο προέρχεται από ένα άλλο κύτταρο που έζησε πριν από αυτό.
- Ο πυρήνας είναι το βασικό στοιχείο του κυττάρου.