Η μυκοετεροτροφία είναι μια σχέση μεταξύ ορισμένων φυτών και μυκήτων. Το φυτό παίρνει όλη ή μέρος της τροφής του από τον παρασιτισμό σε μύκητες και όχι από τη φωτοσύνθεση.
Στο παρελθόν θεωρούσαν ότι τα μη φωτοσυνθετικά φυτά έπαιρναν τροφή διασπώντας οργανική ύλη, όπως κάνουν οι μύκητες. Συνεπώς, τα φυτά αυτά ονομάζονταν "σαπρόφυτα". Αυτό ήταν λάθος. Είναι πλέον γνωστό ότι κανένα φυτό δεν είναι φυσιολογικά ικανό να διασπάσει άμεσα την οργανική ύλη.
Για να αποκτήσουν τροφή, τα μη φωτοσυνθετικά φυτά επιδίδονται σε παρασιτισμό, με μυκοετεροτροφία ή άμεσο παρασιτισμό άλλων φυτών.
Η διεπαφή μεταξύ του φυτού και των μυκητιακών εταίρων σε αυτή την ένωση είναι μεταξύ των ριζών του φυτού και του μυκηλίου του μύκητα. Συνεπώς, η μυκοετεροτροφία μοιάζει πολύ με τη μυκόρριζα και θεωρείται ότι έχει εξελιχθεί από τη μυκόρριζα.


