Η ρύπανση των υδάτων είναι η ρύπανση των υδάτινων σωμάτων, όπως οι λίμνες, τα ποτάμια, οι θάλασσες, οι ωκεανοί, καθώς και τα υπόγεια ύδατα. Συμβαίνει όταν οι ρύποι φτάνουν σε αυτά τα υδάτινα σώματα, χωρίς επεξεργασία. Απόβλητα από σπίτια, εργοστάσια και άλλα κτίρια εισέρχονται στα υδάτινα σώματα με αποτέλεσμα να μολύνεται το νερό .
Η ρύπανση των υδάτων αποτελεί πρόβλημα για τα είδη και τα οικοσυστήματα εκεί. Επηρεάζει τα φυτά και τους οργανισμούς που ζουν στο νερό. Σχεδόν σε όλες τις περιπτώσεις η επίδραση είναι επιζήμια όχι μόνο για μεμονωμένα είδη και πληθυσμούς, αλλά και για τις ευρύτερες βιολογικές κοινότητες. Το χρώμα είναι συνήθως πράσινο ή καφέ, αλλά το κανονικό νερό μπορεί να είναι μπλε.
Η γεωργία είναι μια από τις κύριες πηγές ρύπανσης των υδάτων. Τα λιπάσματα που δίνονται στις καλλιέργειες για καλύτερη ανάπτυξη εκπλένονται στα ποτάμια και τις λίμνες, γεγονός που με τη σειρά του μολύνει το νερό.
Υπάρχουν πολλές χημικές ουσίες που βρίσκονται φυσικά σε αυτά τα υδάτινα σώματα. Σήμερα το νερό μπορεί να είναι μολυσμένο από νιτρικά άλατα, φωσφορικά άλατα, πετρέλαιο, όξινη βροχή και συντρίμμια όπως ιζήματα, πεσμένοι κορμοί κ.λπ. Όταν οι άνθρωποι και τα ζώα πίνουν νερό από τέτοια ποτάμια, τα δηλητηριώδη χημικά μπορεί να τα επηρεάσουν. Η ζωή στα ποτάμια επηρεάζεται επίσης και οι άνθρωποι που καταναλώνουν ψάρια μπορεί επίσης να έχουν προβλήματα υγείας.
