Η βιοαποικοδόμηση είναι μια χημική διαδικασία κατά την οποία τα υλικά διαλύονται από βακτήρια ή άλλα βιολογικά στοιχεία. Εάν ένα υλικό είναι βιοδιασπώμενο, σημαίνει ότι μπορεί να καταναλωθεί από μικροοργανισμούς και να μετατραπεί σε ενώσεις που είναι φυσικές. Πρόκειται για μια σημαντική διαδικασία στην οικολογία και τη διαχείριση αποβλήτων. Τα αντικείμενα που είναι βιοδιασπώμενα θεωρούνται φιλικά προς το περιβάλλον επειδή μπορούν να μετατραπούν ξανά σε στοιχεία που βρίσκονται στη φύση.

Τα οργανικά υλικά, όπως αυτά που προέρχονται από φυτά και ζώα, μπορούν να αποικοδομηθούν αερόβια (με οξυγόνο) ή αναερόβια (χωρίς οξυγόνο). Ορισμένα τεχνητά ή ανόργανα υλικά μπορούν επίσης να αποικοδομηθούν βιολογικά. Είναι δυνατόν να εντοπιστούν συγκεκριμένοι μικροοργανισμοί που είναι σε θέση να βιοαποικοδομήσουν αυτά τα υλικά.

Στη φύση, τα διάφορα υλικά βιοαποικοδομούνται με διαφορετικές ταχύτητες. Οι περισσότεροι μικροοργανισμοί που συμβάλλουν στη βιοαποικοδόμηση χρειάζονται φως, θερμότητα, νερό και οξυγόνο.