Το Πανεπιστήμιο Friedrich Schiller της Ιένας (γερμανικά: Friedrich-Schiller-Universität Jena, συντομογραφία: FSU) είναι ένα πανεπιστήμιο στην Ιένα της Γερμανίας. Ιδρύθηκε το έτος 1558. Το 2009 υπήρχαν περισσότεροι από 21.000 φοιτητές.

Το Πανεπιστήμιο της Ιένας έχει δέκα σχολές:

Το 1934 το Πανεπιστήμιο της Ιένας πήρε το όνομα του Φρίντριχ Σίλλερ. Ο Σίλερ, ένας πολύ διάσημος Γερμανός ποιητής, ήταν καθηγητής στην Ιένα από το έτος 1789.

Το Πανεπιστήμιο της Ιένας είναι μέλος του ομίλου Coimbra, ενός ομίλου πολλών σημαντικών ευρωπαϊκών πανεπιστημίων.