Το Πανεπιστήμιο Friedrich Schiller της Ιένας (γερμανικά: Friedrich-Schiller-Universität Jena, συντομογραφία: FSU) είναι ένα πανεπιστήμιο στην Ιένα της Γερμανίας. Ιδρύθηκε το έτος 1558. Το 2009 υπήρχαν περισσότεροι από 21.000 φοιτητές.
Το Πανεπιστήμιο της Ιένας έχει δέκα σχολές:
- Θεολογία
- Νομολογία
- Οικονομικά
- Φιλοσοφία (συμπεριλαμβανομένων των γλωσσών, της ιστορίας και άλλων)
- Κοινωνικές επιστήμες
- Μαθηματικά και επιστήμη των υπολογιστών
- Φυσική και αστρονομία
- Χημεία και γεωεπιστήμες
- Βιολογία και φαρμακευτική
- Ιατρική
Το 1934 το Πανεπιστήμιο της Ιένας πήρε το όνομα του Φρίντριχ Σίλλερ. Ο Σίλερ, ένας πολύ διάσημος Γερμανός ποιητής, ήταν καθηγητής στην Ιένα από το έτος 1789.
Το Πανεπιστήμιο της Ιένας είναι μέλος του ομίλου Coimbra, ενός ομίλου πολλών σημαντικών ευρωπαϊκών πανεπιστημίων.