Η θειική χονδροϊτίνη είναι μια θειωμένη γλυκοζαμινογλυκάνη (GAG). Πρόκειται για μια αλυσίδα εναλλασσόμενων σακχάρων (Ν-ακετυλογαλακτοζαμίνη και γλυκουρονικό οξύ). Συνήθως βρίσκεται συνδεδεμένη με πρωτεΐνες ως μέρος μιας πρωτεογλυκάνης. Μια αλυσίδα χονδροϊτίνης μπορεί να έχει πάνω από 100 μεμονωμένα σάκχαρα, καθένα από τα οποία μπορεί να θειωθεί σε μεταβλητές θέσεις και ποσότητες. Η θειική χονδροϊτίνη είναι ένα σημαντικό δομικό συστατικό του χόνδρου και παρέχει μεγάλο μέρος της αντίστασής του στη συμπίεση. Μαζί με τη γλυκοζαμίνη, η θειική χονδροϊτίνη έχει γίνει ένα ευρέως χρησιμοποιούμενο συμπλήρωμα διατροφής για τη θεραπεία της οστεοαρθρίτιδας. Συνήθως εξάγεται από χόνδρο καρχαρία.