Αγγελιοφόρος RNA
Η κύρια λειτουργία του RNA είναι να μεταφέρει πληροφορίες για την αλληλουχία αμινοξέων από τα γονίδια στο σημείο όπου οι πρωτεΐνες συναρμολογούνται στα ριβοσώματα στο κυτταρόπλασμα.
Αυτό γίνεται μέσω του αγγελιοφόρου RNA (mRNA). Μια ενιαία αλυσίδα DNA αποτελεί το πρότυπο για το mRNA το οποίο μεταγράφεται από την εν λόγω αλυσίδα DNA. Η αλληλουχία ζευγών βάσεων μεταγράφεται από το DNA από ένα ένζυμο που ονομάζεται RNA πολυμεράση. Στη συνέχεια το mRNA μετακινείται από τον πυρήνα στα ριβοσώματα στο κυτταρόπλασμα για να σχηματίσει πρωτεΐνες. Το mRNA μεταφράζει την αλληλουχία ζευγών βάσεων σε μια αλληλουχία αμινοξέων για να σχηματίσει πρωτεΐνες. Η διαδικασία αυτή ονομάζεται μετάφραση.
Το DNA δεν εγκαταλείπει τον πυρήνα για διάφορους λόγους. Το DNA είναι ένα πολύ μακρύ μόριο και συνδέεται με πρωτεΐνες, τις ιστόνες, στα χρωμοσώματα. Το mRNA, από την άλλη πλευρά, μπορεί να κινείται και να αντιδρά με διάφορα κυτταρικά ένζυμα. Αφού μεταγραφεί, το mRNA αφήνει τον πυρήνα και μετακινείται στα ριβοσώματα.
Δύο είδη μη κωδικών RNA βοηθούν στη διαδικασία οικοδόμησης πρωτεϊνών στο κύτταρο. Πρόκειται για το RNA μεταφοράς (tRNA) και το ριβοσωμικό RNA (rRNA).
tRNA
Το transfer RNA (tRNA) είναι ένα σύντομο μόριο περίπου 80 νουκλεοτιδίων που μεταφέρει ένα συγκεκριμένο αμινοξύ στην πολυπεπτιδική αλυσίδα σε ένα ριβόσωμα. Υπάρχει ένα διαφορετικό tRNA για κάθε αμινοξύ. Κάθε ένα έχει μια θέση για να προσκολληθεί το αμινοξύ και ένα αντικωδικόνιο για να ταιριάζει με το κωδικόνιο στο mRNA. Για παράδειγμα, τα κωδικόνια UUU ή UUC κωδικοποιούν το αμινοξύ φαινυλαλανίνη.
rRNA
Το ριβοσωμικό RNA (rRNA) είναι το καταλυτικό συστατικό των ριβοσωμάτων. Τα ευκαρυωτικά ριβοσώματα περιέχουν τέσσερα διαφορετικά μόρια rRNA: 18S, 5.8S, 28S και 5S rRNA. Τρία από τα μόρια rRNA συντίθενται στον πυρήνα και ένα συντίθεται αλλού. Στο κυτταρόπλασμα, το ριβοσωμικό RNA και η πρωτεΐνη συνδυάζονται για να σχηματίσουν μια πυρηνοπρωτεΐνη που ονομάζεται ριβόσωμα. Το ριβόσωμα δεσμεύει το mRNA και πραγματοποιεί τη σύνθεση των πρωτεϊνών. Πολλά ριβοσώματα μπορεί να είναι συνδεδεμένα με ένα μόνο mRNA ανά πάσα στιγμή. Το rRNA είναι εξαιρετικά άφθονο και αποτελεί το 80% των 10 mg/ml RNA που βρίσκονται σε ένα τυπικό ευκαρυωτικό κυτταρόπλασμα.
snRNAs
Τα μικρά πυρηνικά RNA (snRNA) ενώνονται με πρωτεΐνες για να σχηματίσουν συγκολληματοσωμάτια. Τα σπλησιοσωμάτια ρυθμίζουν την εναλλακτική ωρίμανση. Τα γονίδια κωδικοποιούν πρωτεΐνες σε κομμάτια που ονομάζονται εξόνια. Τα κομμάτια μπορούν να ενωθούν με διαφορετικούς τρόπους για να δημιουργήσουν διαφορετικά mRNA. Έτσι, από ένα γονίδιο μπορούν να παραχθούν πολλές πρωτεΐνες. Αυτή είναι η διαδικασία του εναλλακτικού ματίσματος. Τυχόν ανεπιθύμητες εκδοχές της πρωτεΐνης τεμαχίζονται από πρωτεάσες και τα χημικά κομμάτια επαναχρησιμοποιούνται.