Ο Δεύτερος Στόλος είναι το όνομα της δεύτερης ομάδας πλοίων που στάλθηκε με εποίκους, κατάδικους και προμήθειες στην αποικία στο Sydney Cove στο Port Jackson της Αυστραλίας. Ο στόλος περιλάμβανε έξι πλοία: ένα πλοίο συνοδείας του Βασιλικού Ναυτικού, τέσσερα πλοία καταδίκων και ένα πλοίο ανεφοδιασμού.

Τα πλοία επρόκειτο να πλεύσουν μαζί προς την Αυστραλία και να φτάσουν στον όρμο του Σίδνεϊ το 1789. Ωστόσο, το πλοίο συνοδείας ναυάγησε καθ' οδόν και δεν έφτασε, ενώ ένα πλοίο καταδίκων καθυστέρησε και έφτασε δύο μήνες μετά τα άλλα πλοία.

Σε αντίθεση με τον Πρώτο Στόλο, όπου καταβλήθηκαν μεγάλες προσπάθειες για να διατηρηθούν οι κατάδικοι υγιείς, ο Δεύτερος Στόλος διοικούνταν από ιδιωτικές επιχειρήσεις που κρατούσαν τους κατάδικους σε φρικτές συνθήκες. Όταν έφτασαν στο Σίδνεϊ, οι άρρωστοι κατάδικοι αποτελούσαν επιβάρυνση για την ήδη προβληματική αποικία.