Η βιογεωγραφία είναι η μελέτη της κατανομής των ειδών. Στόχος της είναι να δείξει πού ζουν οι οργανισμοί και γιατί βρίσκονται (ή δεν βρίσκονται) σε μια συγκεκριμένη γεωγραφική περιοχή.

Το βασικό ζήτημα είναι ότι τα ζώα και τα φυτά είναι προσαρμοσμένα στα μέρη στα οποία ζουν, αλλά παρόμοια μέρη έχουν συχνά αρκετά διαφορετικά ζώα και φυτά. Θα περίμενε κανείς, για παράδειγμα, ότι τα ζώα σε ένα τροπικό τροπικό δάσος θα ήταν σχεδόν τα ίδια στην Αμαζονία, την ισημερινή Αφρική και τη Νοτιοανατολική Ασία. Αυτό όμως δεν ισχύει.

Πρέπει να υπάρχουν λόγοι για την κατάσταση αυτή. Αυτοί οι λόγοι αποτελούν αντικείμενο έρευνας της βιογεωγραφίας. Αρχικά, από το 1800-1855 περίπου, οι φυσικοί ιστορικοί συνέταξαν καταλόγους ειδών σε διάφορες περιοχές του κόσμου. Οι κατάλογοι αυτοί δημοσιεύονταν ως πίνακες στα βιβλία τους. Η επανάσταση ξεκίνησε με τον Κάρολο Δαρβίνο και τον Alfred Russel Wallace, οι οποίοι δημοσίευσαν την ιδέα της εξέλιξης μέσω της φυσικής επιλογής. Είχαν ταξιδέψει σε τροπικές χώρες και έγραψαν για τη ζωή στις χώρες αυτές. Είπαν ότι η εξέλιξη ήταν το κλειδί για την κατανόηση της γεωγραφικής κατανομής.

Τα νέα είδη προκύπτουν συνήθως από τη διάσπαση ενός παλαιότερου είδους στα δύο: την ειδογένεση. Αυτό λαμβάνει χώρα σε ορισμένο χρόνο και τόπο. Από εκείνο το μέρος, το νέο είδος μπορεί να ταξιδέψει. Θα εμποδιστεί από γεωγραφικά χαρακτηριστικά (θάλασσες, βουνά...) και από το κλίμα. Έτσι, ένα είδος μπορεί να μην φτάσει ποτέ σε άλλα μέρη όπου θα μπορούσε να έχει μεγάλη επιτυχία. Αυτός, σε γενικές γραμμές, είναι ο λόγος για τον οποίο χώρες με παρόμοιο κλίμα έχουν συχνά αρκετά διαφορετικά ζώα και φυτά. Κλασικά παραδείγματα είναι τα μαρσιποφόρα της Αυστραλίας και η Μεγάλη Αμερικανική Αλλαγή.

Φυσικά, διαφορετικά είδη ζώων και φυτών έχουν διαφορετική κινητικότητα. Για τα πουλιά και τα έντομα είναι ευκολότερο να ταξιδεύουν με πτήση, ενώ στη θάλασσα τα ψάρια μπορούν να ταξιδεύουν εύκολα. Παρόλα αυτά, υπάρχουν όρια. Τα ψάρια στις δύο πλευρές της Αμερικής είναι συνήθως διαφορετικά είδη- και τα ψάρια του γλυκού νερού δεν διασκορπίζονται πολύ. Έτσι προκύπτει αυτό: