Η Μεγάλη Αμερικανική Ανταλλαγή ήταν ένα σημαντικό ζωογεωγραφικό γεγονός πριν από περίπου τρία εκατομμύρια χρόνια. Η χερσαία πανίδα και η πανίδα του γλυκού νερού μετανάστευσαν μεταξύ της Βόρειας και της Νότιας Αμερικής.

Η μετανάστευση έγινε κατά τη διάρκεια του Πλειόκαινου, πριν από 3,6-2,6 εκατομμύρια χρόνια (mya). Ο ηφαιστειακός Ισθμός του Παναμά αναδύθηκε από τον πυθμένα της θάλασσας και γεφύρωσε τις δύο ηπείρους.

Η χερσαία γέφυρα στον σημερινό Παναμά ένωσε τη Νεοτροπική (περίπου Νότια Αμερική) και τη Νεαρκτική (περίπου Βόρεια Αμερική) οικοζώνη για να σχηματίσει την Αμερική.

Η εναλλαγή είναι ορατή τόσο από τη στρωματογραφία όσο και από τη φύση. Η πιο δραματική επίδρασή της αφορά την κατανομή των θηλαστικών, αλλά μεταναστεύουν επίσης πτηνά που πετάνε αδύναμα ή χωρίς πτήση, ερπετά, αμφίβια, αρθρόποδα, ακόμη και ψάρια του γλυκού νερού.

Οι διαφορές στην πανίδα της Βόρειας και της Νότιας Αμερικής ήταν γνωστές εδώ και αρκετό καιρό. Τόσο ο Humboldt όσο και ο Δαρβίνος το συζήτησαν. Η εναλλαγή ως έννοια διατυπώθηκε πλήρως το 1876 από τον "πατέρα της βιογεωγραφίας", τον Alfred Russel Wallace. Ο Γουάλας είχε περάσει το 1848-1852 εξερευνώντας και συλλέγοντας δείγματα στη λεκάνη του Αμαζονίου. Άλλοι που συνέβαλαν σημαντικά στην κατανόηση του γεγονότος τον αιώνα που ακολούθησε είναι ο Florentino Ameghino και ο George Gaylord Simpson.

Παρόμοιες ανταλλαγές συνέβησαν νωρίτερα στον Καϊνοζωικό αιώνα, όταν οι πρώην ήπειροι Γκοντβάνα της Ινδίας και της Αφρικής ήρθαν σε επαφή με την Ευρασία, περίπου 50 και 30 mya αντίστοιχα.