Η εξειδίκευση αφορά τον τρόπο με τον οποίο σχηματίζονται τα είδη. Αποτελεί σημαντικό μέρος της εξελικτικής βιολογίας.

Ο Δαρβίνος πίστευε ότι τα περισσότερα είδη προέκυψαν απευθείας από προϋπάρχοντα είδη. Αυτό ονομάζεται αναγέννηση: είδη μέσω αλλαγής ή "φυλετική εξέλιξη". Για μεγάλο μέρος του 20ού αιώνα πιστεύαμε ότι τα περισσότερα είδη προέκυψαν από τη διάσπαση προηγούμενων ειδών: κλαδογένεση. Η γενική άποψη ήταν ότι οι περισσότερες διασπάσεις ειδών προκαλούνται ή βοηθούνται στο δρόμο τους από μηχανισμούς απομόνωσης.

Αναμφίβολα, ο φυσικός διαχωρισμός των ειδών που κάποτε ζούσαν μαζί είναι ένας βασικός παράγοντας. Αυτό καταδεικνύεται από πολλά παραδείγματα, μερικά από τα οποία αναλύονται παρακάτω.

Ωστόσο, οι εργασίες των τελευταίων 20 ετών έχουν δείξει κάποιες άλλες αιτίες. Η ανάλυση της αλληλουχίας του DNA των έμβιων όντων έδειξε ότι συχνά υπάρχει κάποια υβριδοποίηση μεταξύ συγγενικών ειδών. Αυτό σημαίνει ότι έχουν μεταφερθεί γονίδια από αυτές τις διασταυρώσεις. Με τη σειρά του, αυτό σημαίνει ότι η αναπαραγωγική απομόνωση δεν είναι ο μόνος ορισμός ενός είδους και ότι η δημιουργία ειδών δεν απαιτεί πάντα αλλοπατρία (τα είδη να είναι αναπαραγωγικά διαχωρισμένα). Οι παρακάτω ενότητες απεικονίζουν την ιδέα ότι ο φυσικός διαχωρισμός ήταν πρωταρχικής σημασίας για τον σχηματισμό νέων ειδών.