Τεχνητή επιλογή είναι η σκόπιμη αναπαραγωγή φυτών ή ζώων. Σημαίνει το ίδιο πράγμα με την επιλεκτική αναπαραγωγή και είναι μια αρχαία μέθοδος γενετικής μηχανικής.

Η επιλεκτική αναπαραγωγή είναι μια τεχνική που χρησιμοποιείται κατά την αναπαραγωγή οικόσιτων ζώων, όπως οι σκύλοι, τα περιστέρια ή τα βοοειδή. Ορισμένα από αυτά τα ζώα μπορεί να έχουν χαρακτηριστικά που ο εκτροφέας θέλει να μεταφέρει στην επόμενη γενιά. Συνεπώς, ο εκτροφέας θα επιλέξει εκείνα τα ζώα προς αναπαραγωγή που έχουν αυτή την ιδιότητα και όχι εκείνα που δεν την έχουν.

Η ενδογαμία είναι ένα ιδιαίτερο είδος επιλεκτικής αναπαραγωγής, σχεδιασμένο για την παραγωγή ενός πληθυσμού που είναι γενετικά σχεδόν πανομοιότυπος. Τέτοιοι πληθυσμοί είναι σπάνια βιώσιμοι εκτός εργαστηρίου. Χάνουν τη γονιμότητά τους. Για να ελεγχθεί αυτό, οι περισσότερες φυλές διασταυρώνονται ή αντιδιασταυρώνονται με άτομα άγριου τύπου ή τουλάχιστον με λιγότερο ενδογαμικό απόθεμα. Οι λεπτομέρειες διαφέρουν από φυλή σε φυλή. Η βελτίωση όταν γίνεται διασταύρωση ονομάζεται υβριδική ευρωστία.

Ο Κάρολος Δαρβίνος χρησιμοποίησε το παράδειγμα της τεχνητής επιλογής για να παρουσιάσει την ιδέα του για τη φυσική επιλογή. Η τεχνητή επιλογή μπορεί να αντιπαραβληθεί με τη διαδικασία της φυσικής επιλογής. Στη φυσική επιλογή, συμβαίνει η διαφορική αναπαραγωγή οργανισμών με συγκεκριμένα χαρακτηριστικά. Αυτό συμβαίνει επειδή ορισμένες παραλλαγές βοηθούν τον οργανισμό να έχει καλύτερη επιβίωση και αναπαραγωγή. Η διαδικασία αυτή διατηρεί ή ενισχύει την καταλληλότητα ενός πληθυσμού στο φυσικό του περιβάλλον.

Η τεχνητή επιλογή μπορεί μερικές φορές να είναι ακούσια- πιστεύεται ότι η εξημέρωση των καλλιεργειών από τους πρώτους ανθρώπους ήταν σε μεγάλο βαθμό ακούσια.