Οι επιφάνειες των φύλλων είναι διάσπαρτες με ανοίγματα που ονομάζονται στομάτια, τα οποία λειτουργούν μάλλον σαν πόροι. Στα περισσότερα φυτά υπάρχουν περισσότερα στην κάτω πλευρά των φύλλων απ' ό,τι στην επάνω. Τα στομάτια οριοθετούνται από κύτταρα-φύλακες που ανοίγουν και κλείνουν τον πόρο. Η διαπνοή συμβαίνει όταν τα προστατευτικά κύτταρα ανοίγουν τα στομάτια. Αυτό επιτρέπει την έξοδο του οξυγόνου και των υδρατμών και την είσοδο του διοξειδίου του άνθρακα. Το διοξείδιο του άνθρακα χρησιμοποιείται στη φωτοσύνθεση και το οξυγόνο παράγεται από τη φωτοσύνθεση.
Η διαπνοή τραβά επίσης νερό μέσα από το φυτό. Αυτό μεταφέρει μαζί του τα ανόργανα θρεπτικά συστατικά από τις ρίζες στους βλαστούς. Το νερό μετακινείται από τα φύλλα στην ατμόσφαιρα. Αυτό ασκεί μια έλξη στη στήλη νερού, η οποία φέρνει το νερό προς τα πάνω ενάντια στη βαρύτητα. Το νερό εισέρχεται στο φυτό στις ρίζες μέσω όσμωσης και μεταφέρει διαλυμένα ανόργανα θρεπτικά συστατικά στα ανώτερα τμήματα του φυτού μέσω του ξυλώματος. Ένα πλήρως ανεπτυγμένο δέντρο μπορεί να χάσει αρκετές εκατοντάδες γαλόνια νερού μέσω των φύλλων του σε μια ζεστή, ξηρή ημέρα. Περίπου το 90% του νερού που εισέρχεται στις ρίζες ενός φυτού χρησιμοποιείται για τη διαδικασία αυτή.
Τα φυτά της ερήμου και τα κωνοφόρα έχουν προσαρμογές που μειώνουν την απώλεια νερού. Παραδείγματα είναι: παχιά επιδερμίδα, μειωμένες επιφάνειες φύλλων, βυθισμένα στόματα και τρίχες. Όλα αυτά μειώνουν τη διαπνοή και εξοικονομούν νερό. Πολλοί κάκτοι κάνουν φωτοσύνθεση σε χυμώδεις μίσχους, αντί για φύλλα. Η επιφάνεια ακόμη και ενός παχού στελέχους είναι πολύ μικρότερη από τη συνολική επιφάνεια των φύλλων ενός δέντρου. Επίσης, τα στόματα των φυτών της ερήμου είναι συνήθως κλειστά κατά τη διάρκεια της ημέρας και ανοίγουν τη νύχτα, όταν η διαπνοή είναι χαμηλότερη.
