Η μικροπαλαιοντολογία (που μερικές φορές γράφεται και ως μικροπαλαιοντολογία) είναι ο κλάδος της παλαιοντολογίας που μελετά τα μικροαπολιθώματα. Τα μικροαπολιθώματα είναι απολιθώματα γενικά όχι μεγαλύτερα από τέσσερα χιλιοστά και συνήθως μικρότερα από ένα χιλιοστό. Για τη μελέτη τους χρησιμοποιείται μικροσκόπιο. Κάθε βασίλειο οργανισμών αντιπροσωπεύεται στα αρχεία μικροαπολιθωμάτων. Τα μικροαπολιθώματα μπορούν να παρέχουν σημαντικές πληροφορίες για την οικολογία στο παρελθόν.
Οι άνθρωποι που μελετούν τη μικροπαλαιοντολογία ονομάζονται μικροπαλαιοντολόγοι. Η ταξινομία και η στατιστική είναι σημαντικά μέρη της μικροπαλαιοντολογίας.
Τα μικροαπολιθώματα είναι πιο συνηθισμένα σε ιζήματα που σχηματίζονται κάτω από το νερό, ιδίως το νερό των ωκεανών ή των λιμνών. Πολύ παλιά μικροαπολιθώματα μπορεί να βρεθούν σε πετρώματα. Για τον διαχωρισμό των μικροαπολιθωμάτων από τα πετρώματα χρησιμοποιούνται ειδικές τεχνικές. Για παράδειγμα, τα κελύφη των διατόμων και ορισμένων άλλων οργανισμών αποτελούνται από πυρίτιο- άλλα υλικά στο πέτρωμα μπορούν μερικές φορές να αφαιρεθούν με οξύ, αφήνοντας μόνο τα κελύφη πυριτίου.
Η μικροπαλαιοντολογία μπορεί να χωριστεί σε τέσσερις τομείς μελέτης. Οι διάφοροι τομείς μελέτης χρησιμοποιούν διαφορετικές τεχνικές για τον διαχωρισμό των μικροαπολιθωμάτων. Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι τα μικροαπολιθώματα αποτελούνται από διαφορετικά ορυκτά:
- Διοξείδιο του πυριτίου, για παράδειγμα στα κελύφη των διατόμων,
- Κιμωλία, π.χ. στα κελύφη των κοκκολίθων και των φορμινίφερων,
- Φωσφορικά άλατα, για παράδειγμα στα οστά των σπονδυλωτών,
- Οργανικές ενώσεις, για παράδειγμα στη γύρη και τα σπόρια.
Ο τομέας μελέτης της γύρης και των σπορίων, συμπεριλαμβανομένων των απολιθωμάτων, ονομάζεται παλυνολογία.
