Ένας οργανισμός είναι ένα μεμονωμένο ζωντανό πράγμα. Είναι εύκολο να αναγνωρίσουμε ένα ζωντανό πράγμα, αλλά όχι τόσο εύκολο να το ορίσουμε. Τα ζώα και τα φυτά είναι οργανισμοί, προφανώς. Οι οργανισμοί είναι ένα βιοτικό, ή ζωντανό, μέρος του περιβάλλοντος. Οι βράχοι και η ηλιοφάνεια είναι μέρη του μη ζωντανού περιβάλλοντος.

Οι οργανισμοί έχουν συνήθως πέντε βασικές ανάγκες για να συνεχίσουν το μεταβολισμό τους. Χρειάζονται αέρα, νερό, θρεπτικά συστατικά (τροφή), ενέργεια και ένα μέρος για να ζήσουν. Ωστόσο, δεν χρειάζονται όλα τα έμβια όντα όλα αυτά ταυτόχρονα. Πολλοί οργανισμοί δεν χρειάζονται καθόλου πρόσβαση στον αέρα.

Χρειάζεται λίγη σκέψη σχετικά με τους ιούς. Δεν υπάρχει συμφωνία ως προς το αν πρέπει να θεωρούνται ζωντανοί. Αποτελούνται από πρωτεΐνες και νουκλεϊκά οξέα και εξελίσσονται, γεγονός που είναι πραγματικά σημαντικό. Ωστόσο, υπάρχουν σε δύο εντελώς διαφορετικές φάσεις. Η μία φάση είναι αδρανής, όχι ενεργή. Η άλλη βρίσκεται μέσα σε ένα ζωντανό κύτταρο κάποιου άλλου οργανισμού. Τότε ο ιός είναι πολύ ενεργός και αναπαράγεται. Σκεφτείτε τον παραλληλισμό με ένα πρόγραμμα υπολογιστή. Όταν χρησιμοποιείται είναι ενεργό- όταν δεν χρησιμοποιείται, είναι εντελώς ανενεργό. Εξακολουθεί όμως να είναι ένα πρόγραμμα.

Ένα άλλο παράδειγμα από τη βιολογία είναι ο σπόρος, ο οποίος είναι μια φάση διανομής ενός βακτηρίου, ενός μύκητα ή ορισμένων φυτών. Δεν είναι ενεργά μέχρι να βρεθούν στην κατάλληλη κατάσταση. Έχουν όλα τα λειτουργικά μέρη για να δημιουργήσουν έναν πλήρη οργανισμό, αλλά προς το παρόν είναι απενεργοποιημένα.

Ορισμένοι οργανισμοί αποτελούνται από εκατομμύρια κύτταρα. Είναι πολυκύτταροι οργανισμοί. Πολλοί από αυτούς είναι ορατοί χωρίς τη χρήση μικροσκοπίου.

Οι περισσότεροι οργανισμοί είναι τόσο μικροί που δεν μπορούν να γίνουν αντιληπτοί με γυμνό μάτι. Χρειάζεται μικροσκόπιο για να τους δείτε. Ονομάζονται μικροοργανισμοί. Οι οργανισμοί μπορεί να αποτελούνται από ένα μόνο κύτταρο. Ονομάζονται μονοκύτταροι οργανισμοί ή μονοκύτταροι οργανισμοί. Παραδείγματα είναι τα βακτήρια και τα πρωτόζωα, όπως η αμοιβάδα και το παραμήκιο.