Πρώιμη βασιλεία
Ο Γουλιέλμος επέλεξε να στεφθεί τα Χριστούγεννα. Αυτό συνέβη εν μέρει επειδή πίστευε ότι οι Άγγλοι θα ήταν λιγότερο πιθανό να εξεγερθούν την ημέρα αυτή της μεγάλης γιορτής. Ήταν επίσης μια καλή επιλογή επειδή πίστευε ότι ήταν θέλημα Θεού να γίνει βασιλιάς. Τώρα βασιλιάς, ο Γουλιέλμος πέρασε μερικούς μήνες στην Αγγλία. Στη συνέχεια επέστρεψε στη Νορμανδία αφήνοντας την Αγγλία στα χέρια δύο ικανών ανδρών. Αυτοί ήταν ο ετεροθαλής αδελφός του Odo, ο επίσκοπος του Bayeux και ο William FitzOsbern. Ο Odo έγινε κόμης του Κεντ, ενώ ο FitzOsbern έγινε κόμης του Χέρφορντ. Οι υπόλοιποι τρεις Άγγλοι κόμητες παρέμειναν στη θέση τους. Όταν ο Γουλιέλμος απέπλευσε πίσω στη Νορμανδία μαζί του ήταν πολλοί από τους οπαδούς του. Πολλοί από τους στρατιώτες του που είχαν πληρωθεί και άλλοι που ήθελε να παρακολουθεί. Συγκεκριμένα αυτοί ήταν ο Άγγλος αρχιεπίσκοπος Στίγκαντ και ο Έντγκαρ Άθελινγκ. Έφερε επίσης μαζί του τους υπόλοιπους τρεις Άγγλους κόμητες, τον Έντουιν, τον Μόρκαρ και τον Βαλτέοφ. Αυτό έγινε για να μην μπορέσει κανένας τους να ξεκινήσει εξέγερση όσο εκείνος έλειπε. Ο Γουλιέλμος είχε να φροντίσει τα καθήκοντά του στο σπίτι. Επίσης, πολλοί από τους στρατιώτες του έπρεπε να επιστρέψουν για να κρατήσουν το δουκάτο ασφαλές.
Όταν ο Γουλιέλμος επέστρεψε στο Λονδίνο τον Δεκέμβριο του 1067, άρχισε να ανακαλύπτει τα προβλήματα που είχαν προκύψει όσο έλειπε. Το Χερτφορντσάιρ είχε δεχτεί επιδρομή από Μερτσιάνους. Στη συνέχεια, το Έξετερ δεν είχε αποδεχτεί την εξουσία του νέου βασιλιά. Ο Γουλιέλμος συγκέντρωσε χρήματα από όλα εκείνα τα μέρη της Αγγλίας που θα πλήρωναν. Κάλεσε επίσης αγγλικές εισφορές. Το Έξετερ παραδόθηκε αφού ένας από τους ομήρους του τυφλώθηκε. Αφού υπέταξε το Ντέβον και την Κορνουάλη, όλα φάνηκαν ήσυχα. Στο Γουίντσεστερ ο Γουλιέλμος έστειλε για τη σύζυγό του Ματίλντα, η οποία στέφθηκε βασίλισσα της Αγγλίας εκεί την Πεντηκοστή.
Μέχρι το καλοκαίρι είχαν ξεσπάσει κι άλλες εξεγέρσεις. Ταυτόχρονα, άλλοι εγκατέλειπαν την Αγγλία. Ο Edgar Atheling μαζί με τη μητέρα του και τις αδελφές του έφυγαν για τη Σκωτία, όπου τους υποδέχτηκαν. Στο Βορρά, ισχυρές ομάδες αντι-νορμανδικών συγκεντρώθηκαν γύρω από το Γιορκ. Ο κόμης Έντουιν και ο αδελφός του Μόρκαρ εγκατέλειψαν την αυλή του Γουλιέλμου για να ενωθούν με τους επαναστάτες στο βορρά. Ο Γουλιέλμος έχτισε τότε ένα κάστρο στο Γουόργουικ. Αυτό έκανε τους κόμητες και άλλους να υποκύψουν στον Γουλιέλμο. Ακολούθησαν και άλλα κάστρα. Στη συνέχεια ο Γουλιέλμος μπήκε στο Γιορκ, όπου άλλοι ήρθαν κοντά του και υποτάχθηκαν. Στη συνέχεια διαπραγματεύτηκε με τον βασιλιά των Σκωτσέζων για να αποτρέψει τυχόν εισβολές στην Αγγλία από τον βορρά. Όμως η εκστρατεία του στον Βορρά δεν ήταν τόσο αποτελεσματική όσο νόμιζε. Το 1069 μια δεύτερη εξέγερση εξελίχθηκε σε πόλεμο. Οι άνδρες που είχε αφήσει επικεφαλής ο Γουλιέλμος είχαν σκοτωθεί. Μια μικρή νορμανδική δύναμη αντιστεκόταν στο Γιορκ, όταν ο Γουλιέλμος ήρθε να τους βοηθήσει. Αφού έχτισε άλλο ένα κάστρο, ο Γουλιέλμος άφησε επικεφαλής τον κόμη Γουλιέλμο ΦιτζΌσμπερν. Για τους επόμενους πέντε μήνες ο βορράς ήταν ήσυχος. Αλλά οι βόρειοι Άγγλοι ηγέτες είχαν στείλει μήνυμα στον βασιλιά Σβάιν στη Δανία προσφέροντάς του το στέμμα αν μπορούσε να νικήσει τους Νορμανδούς. Ο Σβάιν έστειλε έναν δανικό στόλο στην Αγγλία.
Το καλοκαίρι του 1069 ο δανικός στόλος εμφανίστηκε στα ανοικτά των ακτών του Κεντ. Κινήθηκε προς τα βόρεια της ακτής, κάνοντας επιδρομές καθώς προχωρούσε. Ο Γουλιέλμος και ο στρατός του βρίσκονταν στο νότο και φρουρούσαν τις επιδρομές. Τελικά ο στόλος ενώθηκε με τους Άγγλους επαναστάτες στις όχθες του ποταμού Χάμπερ. Οι εναπομείναντες Άγγλοι κόμητες εγκατέλειψαν όλοι τον Γουλιέλμο και εντάχθηκαν στις συνδυασμένες αγγλο-δανικές δυνάμεις. Κινήθηκαν εναντίον της νορμανδικής φρουράς στο Γιορκ και σκότωσαν όλους εκτός από μερικές γυναίκες και παιδιά. Ο Γουίλιαμ Μάλετ, ένας Νορμανδός που είχε ζήσει στην Αγγλία πριν από το 1066, γλίτωσε επίσης.
Το Harrying του Βορρά
Ο βόρειος στρατός του Γουλιέλμου εξοντώθηκε και το Γιορκ έγινε ερείπιο. Ταυτόχρονα ξέσπασαν μικρότερες εξεγέρσεις στην Ουαλία και τη νοτιοδυτική Αγγλία. Ο Γουλιέλμος ήξερε ότι είχε πρόβλημα. Ξεκίνησε καλώντας όλους τους διοικητές και τα στρατεύματά του για να ενώσει τις δυνάμεις του. Ο βασιλιάς ήξερε ότι με μικρότερο στρατό έπρεπε να αντιμετωπίσει μία ομάδα επαναστατών κάθε φορά. Έστειλε τον Γουλιέλμο ΦιτζΌσμπερν και τον Μπράιαν της Βρετάνης για να αντιμετωπίσουν το Έξετερ. Ο ίδιος ο Γουλιέλμος πολέμησε έναν στρατό που κινούνταν από τα ανατολικά. Και στις δύο περιπτώσεις οι νορμανδικοί στρατοί ήταν νικητές. Τώρα κινήθηκε εναντίον των βόρειων στρατών που είχαν καταστρέψει το Γιορκ. Αλλά δεν μπόρεσε να φτάσει πιο βόρεια από το Πόντεφρακτ. Μετά από προσπάθειες αρκετών εβδομάδων ο Γουλιέλμος δωροδόκησε τον δανικό στόλο για να αποσυρθεί από το Γιορκ για τον χειμώνα. Εκείνοι συμφώνησαν και επέστρεψαν στις εκβολές του Χάμπερ για να ξεχειμωνιάσουν εκεί. Ο Γουλιέλμος ήταν πλέον σε θέση να κινηθεί προς το Γιορκ. Ανακατασκεύασε τα κάστρα εκεί. Στη συνέχεια έβαλε τις δυνάμεις του να απλωθούν και να καταστρέψουν ό,τι ήταν χρήσιμο για να τραφεί ο αγγλικός και ο δανικός στρατός. Το αποτέλεσμα ήταν εκτεταμένη πείνα και οι κάτοικοι της περιοχής είτε έφυγαν είτε πέθαναν από την πείνα. Αυτή ήταν η διαβόητη παρενόχληση του Γουλιέλμου στον Βορρά. Το αποτέλεσμα όλων αυτών ήταν η παράδοση των Άγγλων κόμηδων του και των περισσότερων επαναστατών στην Αγγλία. Οι λίγες εναπομείνασες ομάδες συντρίφθηκαν γρήγορα από τον στρατό του Γουλιέλμου. Μια ομάδα όμως αποδείχθηκε πιο πεισματάρα. Αυτή βρισκόταν στο Τσέστερ και μετά από μια αναγκαστική πορεία κατά τη διάρκεια του Χειμώνα, ο Γουλιέλμος τους αιφνιδίασε πριν να είναι έτοιμοι. Μετά την παράδοσή τους έχτισε δύο ακόμη κάστρα εκεί και στη συνέχεια επέστρεψε στο Γουίντσεστερ.
Κυβερνώντας την Αγγλία και τη Νορμανδία
Ο Γουλιέλμος δεν χρειάστηκε ποτέ ξανά να καταστρέψει μια κομητεία όπως έκανε στο Γιορκσάιρ. Είχε αντιμετωπίσει τις κύριες απειλές για την κυριαρχία του, αλλά ορισμένες είχαν επιλυθεί μόνο εν μέρει. Ο δανικός στόλος επέστρεψε το 1070, αυτή τη φορά με επικεφαλής τον βασιλιά Σουέν. Ενώθηκαν με μια μικρή ομάδα επαναστατών στη νήσο Ίλι, με επικεφαλής τον Χέρεγουορντ τον Ξύπνιο. Και πάλι ο Γουλιέλμος δωροδόκησε τους Δανούς για να φύγουν και στη συνέχεια αντιμετώπισε τους επαναστάτες. Ο Χέρεγουορντ δεν ξανακούστηκε ποτέ.
Ο Γουλιέλμος έπρεπε τώρα να κυβερνήσει τόσο την Αγγλία όσο και τη Νορμανδία. Διαπίστωσε ότι έπρεπε να είναι παρών για να διατηρεί τα πράγματα υπό έλεγχο. Όταν βρισκόταν στη Νορμανδία, συχνά ξεσπούσαν προβλήματα στην Αγγλία. Όταν όμως βρισκόταν στην Αγγλία, η Νορμανδία κυβερνιόταν από τη σύζυγό του Ματίλντα. Όμως ο Φουλκ Ρετσέν, ο νέος κόμης του Ανζού, είχε πάρει τη Μαινδή από τον έλεγχο του Γουλιέλμου. Ο Γουλιέλμος αναγκάστηκε να την πάρει πίσω το 1073.
Το 1082 ο Γουλιέλμος συνέλαβε τον ετεροθαλή αδελφό του Odo, επίσκοπο του Bayeux και κόμη του Kent. Οι λόγοι είναι αβέβαιοι, αλλά ο Odo προσπαθούσε να συγκεντρώσει στρατό για να προελάσει στη Ρώμη. Το σχέδιό του ήταν να γίνει ο επόμενος Πάπας. Ο Γουλιέλμος τον δίκασε στη νήσο Γουάιτ. Εκτός από άλλα εγκλήματα ήταν και αυτό της προσπάθειας να συγκεντρώσει στρατό μεταξύ των στρατιωτών του Γουλιέλμου. Όπως τόνισε ο Γουλιέλμος, τους χρειαζόταν για την άμυνα της Αγγλίας. Ο Όντο διαμαρτυρήθηκε ότι ούτε ένας βασιλιάς δεν μπορούσε να τον κρίνει. Ως επίσκοπος μόνο ο Πάπας μπορούσε να τον κρίνει. Ο Γουλιέλμος απάντησε ότι δεν έπιανε έναν επίσκοπο, αλλά τον κόμη του, τον οποίο άφησε υπεύθυνο κατά τη διάρκεια της απουσίας του. Ο Όντο φυλακίστηκε στη Νορμανδία για το υπόλοιπο της ζωής του.
Το 1083 η βασίλισσα Ματίλντα πέθανε και θάφτηκε στην Καέν. Οι δύο τους ήταν πολύ δεμένοι και διαφωνούσαν μόνο για τον γιο τους Ροβέρτο Κούρθοζε. Ο Ρόμπερτ είχε επανειλημμένα επαναστατήσει εναντίον του πατέρα του, αλλά διατηρούσε επαφή με τη μητέρα του. Αυτό προκάλεσε ρήξη μεταξύ τους. Ο Φίλιππος Α΄ της Γαλλίας δυσκολευόταν να κάνει τον υποτελή του βασιλιά όπως ο ίδιος και έτσι δυσανασχετούσε με τον Γουλιέλμο. Επειδή δεν ήταν αρκετά δυνατός για να πολεμήσει ο ίδιος τον Γουλιέλμο, όταν ο Ροβέρτος Κούρθος επαναστάτησε εναντίον του πατέρα του, ο βασιλιάς Φίλιππος τον βοήθησε.
Το καλοκαίρι του 1085 ο Γουλιέλμος έμαθε ότι ο Κανούτ Δ' της Δανίας ετοίμαζε στόλο για να σαλπάρει εναντίον της Αγγλίας. Ο Γουλιέλμος επέστρεψε στην Αγγλία το φθινόπωρο με πολλούς στρατιώτες. Έπρεπε να τους πληρώσει και να τους ταΐσει, με μεγάλο κόστος. Ίσως εκείνη τη στιγμή να συνειδητοποίησε ότι δεν είχε κανένα αρχείο για όσα του όφειλε ως βασιλιάς. Δεν ήξερε αν εισέπραττε όλους τους φόρους που όφειλε.
Domesday Book
Στη χριστουγεννιάτικη αυλή του στο Γκλόστερ το 1085 ο Γουλιέλμος ζήτησε να γίνει μια μεγάλη έρευνα σε κάθε μέρος της Αγγλίας. Ο βασιλιάς ήθελε να μάθει πόσοι άνθρωποι ζούσαν στο [βασίλειό του|[βασίλειο]]. Ήθελε να γνωρίζει το μέγεθος κάθε ιδιοκτησίας, τι άξιζε η καθεμία και πόσα έσοδα απέφερε. Καμία τέτοια έρευνα δεν είχε γίνει ποτέ στο παρελθόν στην Αγγλία. Ήταν μοναδική στις λεπτομέρειές της και στη συμβολή της στην αγγλική ιστορία. Το Domesday Book ήταν το πρώτο δημόσιο αρχείο στην Αγγλία.
Το κείμενο του βιβλίου χωράει σε δύο τόμους. Ο πρώτος κάλυπτε τριάντα έναν νομούς. Ονομάστηκε "Μεγάλο Domesday" λόγω του μεγέθους του. Ο δεύτερος κάλυπτε τις κομητείες Essex, Norfolk και Suffolk και ονομάστηκε "Little Domesday". Τα γεγονότα καταγράφονταν από διάφορες επιτροπές που αποτελούνταν από επισκόπους και κόμητες. Κάθε πάνελ συγκέντρωνε πληροφορίες για αρκετές κομητείες. Στον Γουλιέλμο παρουσιάστηκε μια μεγάλη συλλογή γραπτών στοιχείων την 1η Αυγούστου 1086. Αυτό έγινε το Domesday Book, αν και δεν θα συνδεόταν σε βιβλία για σχεδόν άλλον έναν αιώνα.
Τα τελευταία χρόνια
Ο Γουίλιαμ πέθανε όταν βρισκόταν στη Ρουέν της Γαλλίας από τραύματα που είχε υποστεί πέφτοντας από ένα άλογο που του ανήκε.