Ιδιωτική δημοσίευση
Το χειρόγραφο βιβλίο του Πότερ είχε τον τίτλο Η ιστορία του Πίτερ Ράμπιτ και ο κήπος του κ. ΜακΓκρέγκορ. Το χειρόγραφο απορρίφθηκε από έξι εκδότες. Ακόμη και ο Frederick Warne & Co. αρνήθηκε να το τυπώσει, παρόλο που είχε δείξει ενδιαφέρον για το έργο της πριν από αρκετά χρόνια. Ορισμένοι εκδότες ήθελαν μια μικρότερη ιστορία. Άλλοι ήθελαν μια μεγαλύτερη ιστορία. Σχεδόν όλοι οι εκδότες ήθελαν οι εικόνες να είναι έγχρωμες. Η Potter απογοητεύτηκε επειδή το βιβλίο της συνέχιζε να απορρίπτεται. Είχε ήδη σχεδιάσει πώς θα έμοιαζε το βιβλίο της. Ήθελε το ύφος και το μέγεθος του βιβλίου της να είναι σαν τον Μικρό Μαύρο Σάμπο. Είχε επίσης ήδη σκεφτεί πόσο θα κόστιζε.
Τελικά, αποφάσισε να εκδώσει η ίδια το βιβλίο. Στις 16 Δεκεμβρίου 1901, τα πρώτα 460 αντίτυπα της ιδιωτικής της έκδοσης Η ιστορία του Πίτερ Κουνέλι μοιράστηκαν στην οικογένεια και τους φίλους της.
Πρώτη εμπορική έκδοση
Το 1901, ένας φίλος της οικογένειας Potter, ο Canon Hardwicke Rawnsley, άλλαξε την ιστορία της Potter σε ποίημα και προσπάθησε να δώσει την εκδοχή του, μαζί με τις εικονογραφήσεις της και μερικά από τα διορθωμένα κείμενά της, στην Frederick Warne & Co. Η εταιρεία αρνήθηκε την εκδοχή του Rawnsley, αλλά ήθελε να δει το πλήρες χειρόγραφο της Potter. Ήλπιζαν ότι το The Tale of Peter Rabbit θα ήταν εξίσου επιτυχημένο με το εξαιρετικά δημοφιλές Little Black Sambo της Helen Bannerman και άλλα παιδικά βιβλία που πωλούνταν εκείνη την εποχή. Όταν όμως ο Warne ρώτησε γιατί δεν υπήρχαν καθόλου χρώματα στις εικονογραφήσεις, ο Potter απάντησε ότι τα χρώματα του κουνελιού-καφέ και του πράσινου δεν είχαν ενδιαφέρον. Ο Γουόρν είπε ότι δεν θα εξέδιδε το βιβλίο, αλλά είπε ότι μπορεί να εξέδιδε αργότερα άλλα βιβλία που έγραψε.
Ο Warne ήθελε έγχρωμη εικονογράφηση στο The Tale of Peter Rabbit, το οποίο αποκαλούσε "βιβλίο του λαγού". Πρότεινε επίσης να χρησιμοποιηθούν μόνο 32 εικονογραφήσεις αντί για τις πρώτες 42 εικονογραφήσεις. Στην αρχή, η Potter δεν ήθελε να χρωματίσει τις εικονογραφήσεις της, αλλά συνειδητοποίησε ότι το να μην χρωματίσει τις εικονογραφήσεις της θα ήταν κακή ιδέα. Έστειλε στον Warne μερικές νέες έγχρωμες εικονογραφήσεις μαζί με ένα αντίγραφο της ιδιωτικής της έκδοσης. Στη συνέχεια, ο Γουόρν έδωσε αυτές τις δύο στον διάσημο καλλιτέχνη εικονογραφημένων βιβλίων, τον Λ. Λέσλι Μπρουκ, για να δει τι γνώμη είχε για τις εικόνες. Ο Μπρουκ ήταν ενθουσιασμένος με τη δουλειά της Πότερ. Την ίδια εποχή, τα μικρά βιβλία με εικόνες έγιναν πολύ δημοφιλή.
Η Potter συνέχισε να δείχνει ιδιωτικά τυπωμένα αντίγραφα στην οικογένεια και τους φίλους της. Σύντομα η πρώτη ιδιωτική εκτύπωση των 250 αντιτύπων εξαντλήθηκε και έπρεπε να ετοιμαστούν άλλα 200. Σημείωσε σε ένα αντίτυπο ότι το κατοικίδιο κουνέλι της Peter είχε πεθάνει στις 26 Ιανουαρίου 1901. Ήταν εννέα ετών.
Οι Potter και Warne συμφώνησαν να εκδώσουν φτηνά 5.000 αντίτυπα. Την επόμενη χρονιά, τον Ιούνιο του 1902 υπογράφηκε επίσημο συμβόλαιο. Η Potter εργάστηκε σκληρά κατά τη διαδικασία έκδοσης της ιστορίας - ζωγράφισε ξανά τις εικόνες της όταν χρειαζόταν, έκανε μικρές αλλαγές στη γραφή και διόρθωσε τη στίξη. Πριν ακόμη εκδοθεί στις αρχές Οκτωβρίου του 1902, τα πρώτα 8.000 αντίτυπα είχαν πουληθεί. Μέχρι το τέλος του έτους είχαν κυκλοφορήσει 28.000 αντίτυπα. Μέχρι τα μέσα του 1903 υπήρξε πέμπτη εκτύπωση και τον ίδιο μήνα υπήρξε και έκτη εκτύπωση. Ένα χρόνο μετά την πρώτη εμπορική έκδοση είχαν τυπωθεί 56.470 αντίτυπα.
Αμερικανικά πνευματικά δικαιώματα
Το γραφείο της Warne στη Νέα Υόρκη δεν κατοχύρωσε τα πνευματικά δικαιώματα για το The Tale of Peter Rabbit στις Ηνωμένες Πολιτείες. Εξαιτίας αυτού, την άνοιξη του 1903 άρχισαν να εμφανίζονται μη αδειοδοτημένα αντίτυπα του βιβλίου. Τίποτα δεν μπορούσε να σταματήσει την εκτύπωση των μη αδειοδοτημένων αντιτύπων.
Αυτό έκανε τον Potter να χάσει πολλά χρήματα. Άρχισε να συνειδητοποιεί πλήρως την ανάγκη να αδειοδοτεί σωστά τα βιβλία της, όταν, αφού είχε εκδώσει με επιτυχία την Ιστορία του Σκίουρου Νάτκιν, ο πατέρας της βρήκε ένα παιχνίδι σκίουρου με το όνομα Νάτκιν στη Στοά Μπέρλινγκτον τα Χριστούγεννα του 1903.