Το 1984, κατά τη διάρκεια ανασκαφών στο Χόκενχαϊμ βρέθηκε ένας παλιός κλίβανος τούβλων. Στο εσωτερικό του κλιβάνου υπήρχαν σφραγισμένα τούβλα από τη Ρωμαϊκή Αυτοκρατορία. Η ρωμαϊκή Legio XIV Gemina βρισκόταν κοντά στο Mainz από το 71 μ.Χ. έως το 92 μ.Χ. Τα τούβλα υποδεικνύουν έναν πρώιμο οικισμό στην περιοχή του Hockenheim.
Το Hockenheim αναφέρεται για πρώτη φορά το 769 ως "Ochinheim" σε ένα έγγραφο του Κώδικα Lorsch (κατάλογος πρώιμων δωρεών μοναστηριών). Το όνομα "Hockenheim" χρησιμοποιήθηκε για πρώτη φορά σε επίσημα έγγραφα το 1238. Κατά τη διάρκεια του Μεσαίωνα, το Hockenheim ανήκε σε διάφορες τοπικές αρχές.
Τον 17ο αιώνα, το Χόκενχαϊμ καταστράφηκε δύο φορές από τα γαλλικά στρατεύματα. Το 1644 κατά τη διάρκεια του Τριακονταετούς Πολέμου και το 1674 κατά τη διάρκεια του Γαλλο-Ολλανδικού Πολέμου. Ο καπνός μεταφέρθηκε στην περιοχή από τους Γάλλους. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, η καλλιέργεια λυκίσκου άρχισε να αντικαθίσταται από τον καπνό. Το 1803 το Χόκενχαϊμ συγχωνεύτηκε με το Μπάντεν. Η καλλιέργεια καπνού αναπτύχθηκε καλά και ευημερούσε και το Χόκενχαϊμ απέκτησε δικαιώματα πόλης στις 22 Ιουλίου 1895.
Στις αρχές του 20ού αιώνα, η καλλιέργεια σπαραγγιών αντικατέστησε το μεγαλύτερο μέρος της εναπομείνασας καλλιέργειας λυκίσκου. Στις 29 Μαΐου 1932 το Hockenheimring εγκαινιάστηκε με έναν αγώνα μοτοσικλέτας. Τον Ιανουάριο του 1973, το Hockenheim εντάχθηκε στο νέο Rhein-Neckar-Kreis (περιφέρεια).