Ο ποταμός San Joaquin είναι ένας από τους δύο μεγαλύτερους ποταμούς της Καλιφόρνιας, στις Ηνωμένες Πολιτείες. Με μήκος 330 μίλια (530 χλμ.), είναι ο δεύτερος μεγαλύτερος ποταμός στην Καλιφόρνια, μετά τον ποταμό Σακραμέντο. Ξεκινά από τα δυτικά βουνά Σιέρα Νεβάδα και ρέει δυτικά και βόρεια μέχρι να καταλήξει στον κόλπο του Σαν Φρανσίσκο, στο Δέλτα Σακραμέντο-Σαν Χοακίν. Η λεκάνη του, η οποία έχει έκταση περίπου 32.000 τετραγωνικά μίλια (82.879 τετραγωνικά χιλιόμετρα), περιλαμβάνει κυρίως γεωργικές εκτάσεις. Ο ποταμός παρέχει πόσιμο νερό σε πάνω από 22 εκατομμύρια πολίτες της Καλιφόρνιας. Οι τρεις μεγαλύτεροι παραπόταμοί του είναι οι ποταμοί Merced, Tuolumne και Stanislaus.
Ο ποταμός ήταν κάποτε ένα από τα πλουσιότερα ποτάμια οικοσυστήματα στην Καλιφόρνια. Ωστόσο, τώρα πάνω από 60 μίλια (97 χλμ.) του ποταμού είναι ξηρά, εκτός από τις πλημμύρες, επειδή έχει αφαιρεθεί πολύ νερό για άρδευση. Στην πραγματικότητα, κάτω από το φράγμα Friant, ένα φράγμα που κατασκευάστηκε τη δεκαετία του 1940 στον ποταμό San Joaquin, το 95 % της ροής του ποταμού είναι ξηρό. Μεγάλο μέρος του ποταμού είναι μολυσμένο, καταστρέφοντας τον ιστορικό πληθυσμό του σολομού chinook, που κάποτε ήταν ο νοτιότερος στις Ηνωμένες Πολιτείες. Τα φυτοφάρμακα, το σελήνιο και πολλά άλλα τοξικά υλικά μεταφέρονται από τον ποταμό San Joaquin στον κόλπο του Σαν Φρανσίσκο.
Τώρα, ένα από τα μεγαλύτερα έργα στην αμερικανική Δύση έχει ξεκινήσει για την αποκατάσταση του ποταμού San Joaquin. Στις 13 Σεπτεμβρίου 2006, το Συμβούλιο Άμυνας Φυσικών Πόρων υπέγραψε συμφωνία με τους χρήστες του φράγματος Friant και το Υπουργείο Εσωτερικών των Ηνωμένων Πολιτειών. Η συμφωνία αυτή θα αποκαταστήσει τον ποταμό San Joaquin κάτω από το φράγμα, μειώνοντας τη ρύπανση.
