Το φαγκότο είναι το χαμηλότερο από τα τέσσερα κύρια όργανα της οικογένειας των ξύλινων πνευστών. Όπως και το όμποε, έχει διπλό γλωσσίδι. Το γλωσσίδι είναι προσαρτημένο σε ένα καμπυλωτό μεταλλικό επιστόμιο που ονομάζεται "κρόκο" ή "μποκάλ" και το οποίο είναι συνδεδεμένο με το κύριο μέρος του οργάνου. Αυτό αποτελείται από δύο μέρη που ονομάζονται "άρθρωση μπάσου" και "άρθρωση φτερού" (ή "άρθρωση τενόρου"). Αυτά τα δύο συνδέονται στο κάτω μέρος με ένα κομμάτι σε σχήμα U που ονομάζεται "μπότα". Στην κορυφή του οργάνου βρίσκεται η "άρθρωση καμπάνας". Το όργανο είναι αρκετά βαρύ. Ορισμένοι παίκτες έχουν έναν ιμάντα λαιμού γύρω από το λαιμό τους για να στηρίξουν το βάρος, αλλά συνήθως χρησιμοποιούν έναν ιμάντα καθίσματος που συνδέεται στο κάτω μέρος της μπότας και περνάει από το πάτωμα. Ο φαγκουτίστας, ένα άτομο που παίζει φαγκότο, κάθεται στη συνέχεια σε αυτόν τον ιμάντα. Το φαγκότο κρατιέται στη δεξιά πλευρά του φαγκουτίστα και η κορυφή της άρθρωσης της μπότας βρίσκεται συνήθως στο ίδιο επίπεδο με το ισχίο του παίκτη. Το φαγκότο, όταν παίζεται σωστά, μπορεί να ακούγεται πολύ όμορφα. Το φαγκότο έχει ένα από τα μεγαλύτερα εύρη νοτών, από το χαμηλό σι μέχρι το ψηλό φα στην πάνω γραμμή του υψίφωνου κλειδιού. Το φαγκότο μπορεί επίσης να παίξει στο κλειδί του τενόρου, αλλά συνήθως παίζει στο κλειδί του μπάσου.
Ορισμένα φαγκότα έχουν έναν λευκό, ελεφαντόδοντο δακτύλιο γύρω από την κορυφή της άρθρωσης του κουδουνιού. Πρόκειται για γερμανικά φαγκότα (αποκαλούμενα "Heckel"). Τα γαλλικά φαγκότα (που ονομάζονται "Buffet") δεν έχουν αυτό το δαχτυλίδι και επίσης έχουν αρκετά διαφορετικό ήχο από τα γερμανικά φαγκότα. Τα φαγκότα έχουν κλειδιά για να βοηθούν τον παίκτη να καλύπτει όλες τις οπές, αλλά αυτά τα κλειδιά δεν χρησιμοποιούν το σύστημα δακτυλοθεσίας Boehm όπως τα άλλα ξύλινα πνευστά όργανα. Τα γερμανικά φαγκότα χρησιμοποιούν ένα σύστημα που ονομάζεται σύστημα Heckel, ενώ τα γαλλικά φαγκότα χρησιμοποιούν το σύστημα Buffet.
Το φαγκότο θεωρείται συνήθως ως ένα κωμικό όργανο, ωστόσο παίζει πολύ σημαντικό ρόλο στην ορχήστρα.Στην πραγματικότητα, το σαξόφωνο εφευρέθηκε για να αντικαταστήσει το φαγκότο και το όμποε, ωστόσο απορρίφθηκε επειδή δεν ακουγόταν το ίδιο στην ορχήστρα.
