Πρώτος αγγλικός εμφύλιος πόλεμος (1642-46)
Στα μέσα του 1642, και οι δύο πλευρές άρχισαν να ταξιδεύουν σε όλη τη χώρα για να συγκεντρώσουν υποστηρικτές και όπλα. Στις 22 Αυγούστου, ο βασιλιάς Κάρολος ύψωσε τη βασιλική σημαία στο Νότιγχαμ. Με τον τρόπο αυτό, ανακοίνωνε ότι βρισκόταν σε πόλεμο με το Κοινοβούλιο.
Ο βασιλιάς βρήκε μεγαλύτερη υποστήριξη στην ύπαιθρο, στις φτωχότερες περιοχές της χώρας και στη βόρεια και δυτική Αγγλία. Το Κοινοβούλιο βρήκε μεγαλύτερη υποστήριξη στις περισσότερες πόλεις, στα λιμάνια, στα πλουσιότερα μέρη της χώρας και στη νότια και ανατολική Αγγλία. Οι άνθρωποι που ήταν κρυφά καθολικοί υποστήριζαν κυρίως τον βασιλιά. Το Βασιλικό Ναυτικό και οι περισσότεροι Πουριτανοί υποστήριζαν το Κοινοβούλιο. Ορισμένες περιοχές υποστήριξαν το Κοινοβούλιο λόγω τοπικών προβλημάτων, όπως τα έργα αποξήρανσης του εδάφους στο Φενς.
Οι βασιλικοί στρατοί είχαν επικεφαλής τον πρίγκιπα Ρούπερτ, ανιψιό του βασιλιά. Οι κοινοβουλευτικοί στρατοί διοικούνταν αρχικά από τον κόμη του Έσσεξ. Οι Βασιλικοί αποφάσισαν ότι θα προσπαθούσαν να πολεμήσουν τους Κοινοβουλευτικούς γρήγορα και έτσι πήγαν να τους συναντήσουν στο Warwickshire. Η πρώτη μεγάλη μάχη ήταν η μάχη του Edgehill τον Οκτώβριο του 1642. Η μάχη έληξε ισόπαλη. Ο βασιλιάς προσπάθησε να επιστρέψει στο Λονδίνο, αλλά εμποδίστηκε από τον κοινοβουλευτικό στρατό. Μετακόμισε με τους στρατούς του στην Οξφόρδη, όπου είχε περισσότερους πιστούς οπαδούς.
Ο πρώτος χρόνος του πολέμου κύλησε αρκετά καλά για τους Βασιλικούς. Ενίσχυσαν τον έλεγχό τους στα βόρεια και δυτικά, αλλά ήταν λιγότερο επιτυχείς στα Midlands. Μετά τα μέσα του 1643, οι Κοινοβουλευτικοί άρχισαν να τα πηγαίνουν καλύτερα. Κέρδισαν μάχες στο Λίνκολνσαϊρ, στα ανατολικά και στο Νιούμπερι δυτικά του Λονδίνου.
Ο βασιλιάς Κάρολος συνήψε συμφωνία με τους Ιρλανδούς επαναστάτες για να σταματήσουν οι μάχες στην Ιρλανδία, απελευθερώνοντας στρατιώτες που θα μπορούσαν να πολεμήσουν γι' αυτόν. Το Κοινοβούλιο έκανε συμφωνία με τους Σκωτσέζους Covenantors, οι οποίοι θα τους βοηθούσαν. Το Κοινοβούλιο βοηθήθηκε επίσης από έναν ταλαντούχο στρατιωτικό ηγέτη που ονομαζόταν Όλιβερ Κρόμγουελ. Ήταν επικεφαλής μιας μονάδας ιππικού (ιππέων) που ονομαζόταν "Ironsides". Οι Ironsides ήταν καλύτερα οργανωμένοι από τις περισσότερες μονάδες ιππικού, γεγονός που τους έκανε πολύ καλύτερους στη μάχη.
Με τη βοήθεια των Σκωτσέζων και των σιδηρόφρακτων, το Κοινοβούλιο κέρδισε μια σημαντική νίκη στη μάχη του Marston Moor τον Ιούλιο του 1644. Πήραν τον έλεγχο της βόρειας Αγγλίας. Οι Βασιλικοί αποδυναμώθηκαν αλλά δεν είχαν ακόμη ηττηθεί. Κέρδισαν τη μάχη του Lostwithiel στην Κορνουάλη, νικώντας τους στρατιώτες του Essex. Κατάφεραν επίσης να πολεμήσουν ισόπαλοι σε μια δεύτερη μάχη του Νιούμπερι τον Οκτώβριο.
Το 1645, το Κοινοβούλιο οργάνωσε τους στρατιώτες του στο Νέο Μοντέλο Στρατού. Ο κόμης του Έσσεξ αντικαταστάθηκε από τον σερ Τόμας Φέρφαξ. Ο Όλιβερ Κρόμγουελ έγινε αναπληρωτής του Φέρφαξ. Ο στρατός του Νέου Μοντέλου ήταν καλύτερα οργανωμένος από οποιονδήποτε στρατό είχε προηγηθεί. Νίκησε τον μεγαλύτερο στρατό του βασιλιά στη μάχη του Naseby τον Ιούνιο του 1645. Οι περισσότεροι από τους στρατιώτες των Βασιλικών στο Naseby αιχμαλωτίστηκαν. Ο βασιλιάς Κάρολος διέφυγε από το Naseby, αλλά άφησε πίσω τις αποσκευές του, οι οποίες είχαν μέσα επιστολές. Οι κοινοβουλευτικοί τα άνοιξαν και ανακάλυψαν ότι ο βασιλιάς προσπαθούσε να ζητήσει βοήθεια από τους Ιρλανδούς καθολικούς και από τις καθολικές χώρες. Ο βασιλιάς έχασε την υποστήριξή του εξαιτίας αυτού.
Ο άλλος κύριος βασιλικός στρατός ηττήθηκε στη μάχη του Λάνγκπορτ στο Σόμερσετ, ένα μήνα αργότερα. Οι κοινοβουλευτικοί πήραν τον έλεγχο της νοτιοδυτικής Αγγλίας, όπου ήταν αδύναμοι. Ο βασιλιάς Κάρολος προσπάθησε να συγκεντρώσει τους εναπομείναντες υποστηρικτές του στα Μίντλαντς. Πολλές πόλεις-φρούρια στην περιοχή από την Οξφόρδη έως το Νιούαρκ-ον-Τρεντ ήταν ακόμη πιστές σε αυτόν. Τον Μάιο του 1646, ο Κάρολος συνάντησε έναν σκωτσέζικο στρατό στο Νότιγχαμσάιρ. Οι Σκωτσέζοι τον έπιασαν αιχμάλωτο.
Δεύτερος αγγλικός εμφύλιος πόλεμος (1648)
Παρόλο που οι βουλευτές είχαν κερδίσει, ήταν διχασμένοι ως προς τον τρόπο διακυβέρνησης της χώρας. Μια μεγάλη διαφωνία αφορούσε τη θρησκεία. Τα περισσότερα μέλη του Κοινοβουλίου ήθελαν μια πρεσβυτεριανή εθνική εκκλησία. Το Νέο Μοντέλο Στρατού προτιμούσε να επιτραπεί στις τοπικές εκκλησίες να λειτουργούν μόνες τους χωρίς να υπάρχει εθνική εκκλησία. Οι ηττημένοι Βασιλικοί υποστήριζαν την υπάρχουσα Εκκλησία της Αγγλίας, αν και ορισμένοι ήταν κρυφά Καθολικοί. Τόσο το Κοινοβούλιο όσο και ο Στρατός προσπάθησαν να κερδίσουν την υποστήριξη του βασιλιά και των Σκωτσέζων Πρεσβυτεριανών. Ο βασιλιάς Κάρολος βρισκόταν στη φυλακή και περνούσε μεταξύ των ομάδων. Αρνήθηκε να συνάψει συμφωνία με οποιαδήποτε από αυτές, επειδή πίστευε ότι μόνο αυτός είχε το δικαίωμα να κυβερνήσει την Αγγλία. Προσποιήθηκε ότι ενδιαφερόταν να συνάψει συμφωνία, ενώ σχεδίαζε να ανακτήσει τον έλεγχο της χώρας. Οι διαιρέσεις επιδεινώθηκαν όταν το Κοινοβούλιο προσπάθησε να διαλύσει το Νέο Μοντέλο Στρατού.
Ένας δεύτερος πόλεμος ξέσπασε όταν κάποιοι Σκωτσέζοι πρεσβυτεριανοί (που ονομάστηκαν "Engagers") και κάποιοι Άγγλοι πρεσβυτεριανοί συμμάχησαν με τον βασιλιά. Συμφώνησαν να τον υποστηρίξουν με αντάλλαγμα να μετατρέψουν τις αγγλικές και σκωτσέζικες εκκλησίες σε πρεσβυτεριανές εκκλησίες. Οι Σκωτσέζοι εισέβαλαν στην Αγγλία, ενώ σε διάφορα μέρη της Αγγλίας ξέσπασαν βασιλικές εξεγέρσεις. Ορισμένες από τις εξεγέρσεις ηττήθηκαν πολύ εύκολα. Οι εξεγέρσεις στην Ουαλία, το Κεντ, το Έσσεξ και το Κάμπερλαντ ήταν ισχυρότερες, αλλά καταπνίγηκαν από τον στρατό του Νέου Μοντέλου. Οι Βασιλικοί και οι Σκωτσέζοι ηττήθηκαν στη μάχη του Πρέστον τον Αύγουστο του 1648.
Εκτέλεση του βασιλιά Καρόλου Α΄
Ο στρατός του Νέου Μοντέλου είχε τον έλεγχο. Σε ένα γεγονός που ονομάστηκε "Εκκαθάριση του Pride", ο συνταγματάρχης του στρατού Thomas Pride απομάκρυνε όλα τα μέλη του Κοινοβουλίου που δεν είχαν υποστηρίξει τον στρατό. Έμειναν μόνο 75 μέλη. Ο στρατός τους έθεσε επικεφαλής της χώρας, και αυτό το Κοινοβούλιο ονομάστηκε Κοινοβούλιο του Κατεστραμμένου.
Το κοινοβούλιο του Rump αποφάσισε ότι δεν θα συνεργαζόταν πλέον με τον βασιλιά Κάρολο. Τον έβαλαν σε δίκη. Στις 27 Ιανουαρίου 1649, η δίκη τον έκρινε ένοχο για προδοσία και τον αποκάλεσε "τύραννο, προδότη, δολοφόνο και δημόσιο εχθρό". Αποκεφαλίστηκε τρεις ημέρες αργότερα.
Πολλοί ιστορικοί λένε ότι η εκτέλεση του βασιλιά Καρόλου ήταν μια σημαντική στιγμή στην αγγλική ιστορία, αλλά και στην ιστορία του Δυτικού Κόσμου. Κανένας ευρωπαίος μονάρχης δεν είχε ποτέ στο παρελθόν δικαστεί από τον ίδιο του το λαό. Άλλες χώρες της Ευρώπης είπαν ότι η εκτέλεση ήταν λάθος, αλλά δεν έκαναν και πολλά άλλα. Δεν υποστήριξαν όλοι οι βουλευτές την εκτέλεση. Ο Φέρφαξ πίστευε ότι ήταν λάθος. Παραιτήθηκε από αρχηγός του Στρατού Νέου Μοντέλου και αντικαταστάθηκε από τον Όλιβερ Κρόμγουελ.
Ο επόμενος βασιλιάς θα ήταν ο γιος του Καρόλου, ο πρίγκιπας Κάρολος, ο μελλοντικός βασιλιάς Κάρολος Β'. Αντ' αυτού, το Κοινοβούλιο ανακοίνωσε ότι η Αγγλία θα γινόταν δημοκρατία, η οποία θα ονομαζόταν Κοινοπολιτεία της Αγγλίας. Ωστόσο, ο πρίγκιπας Κάρολος θα μπορούσε ακόμη να γίνει βασιλιάς της Σκωτίας.
Τρίτος αγγλικός εμφύλιος πόλεμος (1649-51)
Ο τρίτος αγγλικός εμφύλιος πόλεμος ήταν στην πραγματικότητα περισσότερο μια μάχη μεταξύ σκωτσέζικου και αγγλικού στρατού, και μεγάλο μέρος του διεξήχθη στη Σκωτία.
Το 1649, ο μαρκήσιος του Μοντρόουζ ξεκίνησε μια εξέγερση στη Σκωτία για να υποστηρίξει τον βασιλιά Κάρολο Β'. Αντί να υποστηρίξει τον Μοντρόουζ, ο Κάρολος αποφάσισε να συμμαχήσει με τους Σκωτσέζους Covenantors. Φοβήθηκαν ότι η Κοινοπολιτεία της Αγγλίας θα εμπόδιζε τη Σκωτία να έχει πρεσβυτεριανή εκκλησία. Ο Μοντρόουζ ηττήθηκε από σκωτσέζικους στρατούς τον Απρίλιο του 1650. Τον Ιούνιο, ο Κάρολος αποβιβάστηκε στη Σκωτία και υπέγραψε συμφωνία με τους Σκωτσέζους Covenantors.
Ο Κρόμγουελ ταξίδεψε στη Σκωτία και έφτασε τον επόμενο μήνα. Κατά τη διάρκεια του επόμενου έτους, πήρε τον έλεγχο των κυριότερων περιοχών της Σκωτίας. Όταν ο Κάρολος κατέφυγε στην Αγγλία, ο Κρόμγουελ τον ακολούθησε, αφήνοντας τον Γεώργιο Μονκ να ολοκληρώσει τη νίκη στον πόλεμο στη Σκωτία. Όταν αυτό έγινε, η Σκωτία έγινε μέρος της Κοινοπολιτείας της Αγγλίας.
Ο στρατός του Καρόλου βάδισε σε όλη την Αγγλία προς τις δυτικές περιοχές όπου οι Βασιλικοί είχαν τη μεγαλύτερη υποστήριξη. Ωστόσο, δεν μπόρεσαν να βρουν όσους υποστηρικτές ήθελαν. Ο Κρόμγουελ τους βρήκε και τους νίκησε στη μάχη του Γουόρσεστερ στις 3 Σεπτεμβρίου 1651. Ο Κάρολος κατέφυγε στις Κάτω Χώρες. Δεν θα επέστρεφε μέχρι το 1660.
Ιρλανδική εξέγερση
Η ιρλανδική εξέγερση που ξεκίνησε το 1641 θα συνεχιστεί μέχρι το 1652. Πολεμήθηκε κυρίως από Ιρλανδούς καθολικούς εναντίον των στρατών των Άγγλων κοινοβουλευτικών, των Σκωτσέζων Covenantors και των προτεσταντών αποίκων στην Ιρλανδία. Στην αρχή οι επαναστάτες πολεμούσαν και αγγλικούς βασιλικούς στρατούς, αλλά αυτό σταμάτησε κυρίως μετά τον Σεπτέμβριο του 1843. Επτά μήνες μετά την έναρξη της εξέγερσης, οι επαναστάτες δημιούργησαν τη δική τους κυβέρνηση στο Κιλκέννυ. Αυτή ήταν γνωστή ως Ιρλανδική Καθολική Συνομοσπονδία.
Το 1649, ο Όλιβερ Κρόμγουελ πήγε στην Ιρλανδία και κατέστειλε την εξέγερσή τους. Ο Κρόμγουελ έμεινε στην Ιρλανδία ως βάναυσος εισβολέας, ιδίως λόγω του μεγάλου αριθμού ανθρώπων που σκοτώθηκαν κατά την πολιορκία της Ντρογκέιντα. Ορισμένες μάχες συνεχίστηκαν στην Ιρλανδία μέχρι το 1653.