Υπήρχαν τρεις κυβερνητικές υπηρεσίες που διηύθυναν στρατόπεδα. Το ενενήντα τοις εκατό των Ιάπωνων Αμερικανών βρίσκονταν σε στρατόπεδα που διαχειριζόταν η Αρχή Πολεμικής Μετεγκατάστασης (WRA). Στα στρατόπεδα της WRA ζούσαν μόνο Ιάπωνες Αμερικανοί.
Το δέκα τοις εκατό των Ιάπωνων Αμερικανών ήταν σε στρατόπεδα μεικτών φυλών. Αυτά διοικούνταν είτε από την Υπηρεσία Μετανάστευσης και Πολιτογράφησης (INS) είτε από τον στρατό των Ηνωμένων Πολιτειών. Πολλοί διαφορετικοί άνθρωποι ήταν έγκλειστοι σε στρατόπεδα της INS και του στρατού. Αυτοί οι άνθρωποι περιελάμβαναν:
- Γερμανοί και Ιταλοί μετανάστες
- Γερμανοαμερικανοί και Ιταλοαμερικανοί
- Ορισμένοι πρόσφυγες
- Εμπορικοί ναυτικοί από τη Γερμανία και την Ιταλία των οποίων τα πλοία κατελήφθησαν από το Πολεμικό Ναυτικό των Ηνωμένων Πολιτειών, καθώς και επιβάτες των πλοίων αυτών
Τα στρατόπεδα της WRA ήταν περιτριγυρισμένα από συρματόπλεγμα. Φυλάσσονταν επίσης από στρατιώτες που περίμεναν σε παρατηρητήρια κρατώντας όπλα. Μερικοί άνθρωποι πυροβολήθηκαν. Για παράδειγμα, ο James Wakasa, ο οποίος βγήκε έξω από το συρματόπλεγμα, πυροβολήθηκε και σκοτώθηκε. Ο φρουρός που τον πυροβόλησε είπε ότι ο Wakasa προσπαθούσε να δραπετεύσει, αλλά οι Ιάπωνες Αμερικανοί στο στρατόπεδο δεν πίστεψαν τον φρουρό. Τα περισσότερα στρατόπεδα βρίσκονταν πολλά μίλια μακριά από την ακτή και συχνά σε αγροτικές περιοχές. Πολλά από τα στρατόπεδα βρίσκονταν στην έρημο, γεγονός που ήταν άβολο για πολλούς από τους Ιάπωνες Αμερικανούς που δεν ήταν συνηθισμένοι σε τέτοιου είδους κλίμα. Αυτό σήμαινε επίσης ότι ακόμη και αν κάποιος δραπέτευε, δεν υπήρχε πουθενά να πάει.
Στα στρατόπεδα, οι άνθρωποι έπρεπε να στέκονται στην ουρά για να φάνε ή να πάνε στην τουαλέτα.
Ένα διάσημο στρατόπεδο ήταν το Manzanar, το οποίο βρισκόταν στην Καλιφόρνια. Πολλοί Ιάπωνες από το Λος Άντζελες και το Σαν Φρανσίσκο στάλθηκαν εκεί. Άλλα στρατόπεδα ήταν το Poston στην Αριζόνα και το Minidoka στο Idaho. Υπήρχαν μερικά στρατόπεδα εκτός των δυτικών ΗΠΑ, όπως το Jerome στο Arkansas. Οι Ιάπωνες Αμερικανοί συχνά συνωστίζονταν σε μικρούς χώρους, όπως πίστες αγώνων δρόμου, πριν σταλούν στα στρατόπεδα.
Τα στρατόπεδα προσπάθησαν να παρέχουν ιατρική περίθαλψη. Πολλοί από τους ανθρώπους που εργάζονταν στα νοσοκομεία των στρατοπέδων ήταν ιαπωνοαμερικανοί γιατροί και νοσηλευτές που ζούσαν στα στρατόπεδα συγκέντρωσης. Ωστόσο, δεν υπήρχαν αρκετοί γιατροί και νοσηλευτές και δεν υπήρχαν αρκετές ιατρικές προμήθειες. Επίσης, οι συνθήκες στα στρατόπεδα συνέβαλαν στην πρόκληση ορισμένων ασθενειών. Για παράδειγμα, ο κ:
- Επειδή οι καταυλισμοί ήταν τόσο πολυπληθείς, οι μολυσματικές ασθένειες εξαπλώνονταν εύκολα. Στις ασθένειες αυτές περιλαμβάνονταν ο τυφοειδής πυρετός, η ευλογιά, ο κοκκύτης, η γρίπη, η διφθερίτιδα και η φυματίωση. Τα στρατόπεδα μπορούσαν να κάνουν εμβόλια για την πρόληψη ορισμένων από αυτές τις ασθένειες, όπως ο τυφοειδής πυρετός και η ευλογιά, αλλά όχι άλλων.
- Η κακή υγιεινή προκάλεσε κρούσματα τροφικής δηλητηρίασης σε πολλούς καταυλισμούς.
- Στα στρατόπεδα στην έρημο, υπήρχε τόση σκόνη που οι άνθρωποι με άσθμα και αναπνευστικά προβλήματα χειροτέρεψαν.
- Σε κατασκηνώσεις στο Αρκάνσας, οι άνθρωποι κολλούσαν ελονοσία από κουνούπια.
Συνολικά 1.862 άτομα πέθαναν από ιατρικά προβλήματα κατά τη διάρκεια της παραμονής τους στα στρατόπεδα συγκέντρωσης. Περίπου ένας στους 10 από αυτούς τους ανθρώπους πέθανε από φυματίωση.
