Το εμβόλιο είναι φάρμακο που χορηγείται από γιατρό ή νοσηλευτή και καθιστά λιγότερο πιθανό να προσβληθεί ένα άτομο από μια ασθένεια. Παρέχει ανοσία σε μια μολυσματική ασθένεια που προκαλείται από ένα συγκεκριμένο μικρόβιο (βακτήριο ή ιό). Για παράδειγμα, το εμβόλιο κατά της γρίπης καθιστά λιγότερο πιθανό να προσβληθεί ένα άτομο από γρίπη. Το εμβόλιο κατά της γρίπης συχνά αποκαλείται εμβόλιο κατά της γρίπης.

Τα εμβόλια παρασκευάζονται συνήθως από κάτι που είναι ζωντανό ή ήταν ζωντανό.

Η λέξη "εμβόλιο" προέρχεται από τις λατινικές λέξεις vaccīn-us (από τη λέξη vacca, που σημαίνει "αγελάδα"). Το 1796, ο Έντουαρντ Τζένερ χρησιμοποίησε αγελάδες που είχαν μολυνθεί από την ευλογιά της αγελάδας (variolae vaccinae) για να προστατεύσει τους ανθρώπους από την ευλογιά. Η χρήση εμβολίων ονομάζεται εμβολιασμός.