Το ύσσωπο χρησιμοποιείται ως συστατικό στο eau de Cologne και στο λικέρ Chartreuse. Χρησιμοποιείται επίσης για να χρωματίσει το αλκοόλ Absinthe, μαζί με το φυτό Melissa και τη ρωμαϊκή αψιθιά. Το ύσσωπο χρησιμοποιείται επίσης, συνήθως σε συνδυασμό με άλλα βότανα, όπως η γλυκόριζα, σε φυτικές θεραπείες, ιδίως για παθήσεις των πνευμόνων. Ο ύσσωπος σκοτώνει επίσης τα βακτήρια, κάνει τα τριχοειδή αγγεία ισχυρότερα και μειώνει τις φλεγμονές. Μπορεί να βοηθήσει σε περίπου 81 διαφορετικές ασθένειες, όπως ο καρκίνος, η βρογχίτιδα, η αϋπνία, το οίδημα, το κρυολόγημα κ.λπ. Όταν καταναλώνεται σε μορφή εκχυλίσματος ή τσαγιού, απαλλάσσει από τη βλέννα στην αναπνευστική οδό, η οποία ανακουφίζει από τη συμφόρηση, μπορεί να ρυθμίσει την αρτηριακή πίεση και μπορεί να διαλύσει τα αέρια. Βοηθά επίσης σε προβλήματα του κυκλοφορικού συστήματος, στην επιληψία, στον πυρετό, στην ουρική αρθρίτιδα και σε προβλήματα βάρους. Μπορούν να γίνουν κατάπλασμα από φρέσκο ύσσωπο για να βοηθήσει στην επούλωση πληγών. Δεν πρέπει να χρησιμοποιείται κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης.
Τελετουργική χρήση
Ο ύσσωπος είναι ένα ιερό φυτό που χρησιμοποιείται στον Ιουδαϊσμό. Εμφανίζεται συχνά στην εβραϊκή Βίβλο ως Ezov. Στην Έξοδο 12:22 οι Εβραίοι στην Αίγυπτο έχουν την εντολή: "Πάρτε ένα μάτσο ύσσωπο, βουτήξτε το στο αίμα της λεκάνης και βάλτε λίγο από το αίμα στην κορυφή και στις δύο πλευρές του πλαισίου της πόρτας. Κανένας από εσάς δεν θα βγει από την πόρτα του σπιτιού του μέχρι το πρωί". Χρησιμοποιείται από τους ιερείς στο Ναό του Σολομώντα για τελετές εξαγνισμού διαφόρων ειδών στο Λευιτικό 14:4-7, 14:49-52, 19:6, 18. Ο ύσσωπος χρησιμοποιείται επίσης συχνά για να γεμίσει το Καθολικό τελετουργικό Ασπέργιλλο, το οποίο ο ιερέας βουτάει σε ένα μπολ με αγιασμό και ραντίζει το εκκλησίασμα για να το ευλογήσει. Ωστόσο, οι ερευνητές λένε ότι οι βιβλικές αναφορές δεν αναφέρονται στο φυτό που σήμερα είναι γνωστό ως ύσσωπος. Μπορεί στην πραγματικότητα να πρόκειται για ένα από μια σειρά διαφορετικών βοτάνων.
Το Ταλμούδ αποκαλεί τον ύσσωπο אברתא και θεωρεί ότι είναι ένα φυτικό φάρμακο για τη δυσπεψία.
Στα τρόφιμα
Τα φύλλα ύσσωπου έχουν μια ελαφρώς πικρή γεύση μέντας και μπορούν να προστεθούν σε σούπες, σαλάτες ή κρέατα, αλλά θα πρέπει να χρησιμοποιούνται με φειδώ, καθώς η γεύση τους είναι πολύ έντονη.