Για το μεγαλύτερο μέρος του Ορδοβίκου, η ζωή συνέχισε να ακμάζει, αλλά κοντά στο τέλος της περιόδου το γεγονός της εξαφάνισης στο τέλος του Ορδοβίκου επηρέασε σοβαρά πλαγκτονικές μορφές, όπως οι κωνοδοντικοί, οι γραπτόλιθοι και ορισμένες ομάδες τριλοβιτών. Τα βραχιόποδα, τα βρυόζωα και τα εχινόδερμα επηρεάστηκαν επίσης σε μεγάλο βαθμό, ενώ τα κωνοειδή ναυτιλοειδή εξαφανίστηκαν εντελώς, εκτός από σπάνιες μορφές του Σιλουρίου.
Οι εξαφανίσεις μπορεί να προκλήθηκαν από μια εποχή των παγετώνων που συνέβη στο τέλος της Ορδοβικίας: το τέλος της Ορδοβικίας ήταν μια από τις πιο ψυχρές περιόδους των τελευταίων 600 εκατομμυρίων ετών της ιστορίας της Γης.
Πανίδα
Σε γενικές γραμμές, η πανίδα που εμφανίστηκε στο Ορδοβίκο καθόρισε το σκηνικό για το υπόλοιπο Παλαιοζωικό. Η πανίδα κυριαρχούνταν από αιωρούμενους τροφοδότες, κυρίως με σύντομες τροφικές αλυσίδες. Το οικολογικό σύστημα έφθασε σε ένα νέο επίπεδο πολυπλοκότητας πολύ πέρα από εκείνο της πανίδας του Καμβρίου.
Αν και λιγότερο διάσημη από την έκρηξη της Κάμβριας, η Ορδοβικία παρουσίασε μια προσαρμοστική ακτινοβολία, η οποία δεν ήταν λιγότερο αξιοσημείωτη. Τα θαλάσσια γένη τετραπλασιάστηκαν, με αποτέλεσμα το 12% όλης της γνωστής θαλάσσιας πανίδας του Φανεροζωικού. Μια άλλη αλλαγή στην πανίδα ήταν η έντονη αύξηση των οργανισμών που τρέφονται με φίλτρα. Τα αρθρωτά βραχιόποδα, τα κεφαλόποδα και τα κρινοειδή ανέλαβαν τα ηνία. Τα αρθρωτά βραχιόποδα, ειδικότερα, αντικατέστησαν σε μεγάλο βαθμό τους τριλοβίτες στις κοινότητες της υφαλοκρηπίδας. Αυτό καταδεικνύει τη σημαντικά αυξημένη βιοποικιλότητα των ανθρακικών οργανισμών που εκκρίνουν κέλυφος στο Ορδοβίκο σε σύγκριση με το Κάμβριο. Αν και τα μοναχικά κοράλλια χρονολογούνται τουλάχιστον από το Κάμβριο, τα κοράλλια που σχηματίζουν υφάλους εμφανίστηκαν στις αρχές του Ορδοβίκου.
Τα μαλάκια, τα οποία εμφανίστηκαν κατά τη διάρκεια του Κάμβριου ή ακόμη και του Ενδιακάρανου, έγιναν κοινά και ποικίλα, ιδίως τα δίθυρα, τα γαστερόποδα και τα ναυτιλοειδή κεφαλόποδα. Στους ωκεανούς ευδοκίμησαν τα εξαφανισμένα σήμερα θαλάσσια ζώα που ονομάζονται γκραπτολίτες. Εμφανίστηκαν μερικά νέα κυστοειδή και κρινόζωα.
Για πολύ καιρό θεωρούνταν ότι τα πρώτα αληθινά σπονδυλωτά (ψάρια - Οστρακοδέρμια) εμφανίστηκαν στο Ορδοβίκο, αλλά πρόσφατες ανακαλύψεις στην Κίνα δείχνουν ότι πιθανώς προήλθαν από το Κατώτερο Κάμβριο. Τα πρώτα Gnathostomata (ψάρια με σαγόνια) εμφανίστηκαν στο Ανώτερο Ορδοβίκο.
Κατά τη διάρκεια του Μέσου Ορδοβίκου παρατηρήθηκε μεγάλη αύξηση των οργανισμών βιοερωτογένεσης (οργανισμοί που τρυπάνε όστρακα και πετρώματα). Αυτό είναι γνωστό ως η επανάσταση της βιοδιάβρωσης του Ορδοβίκου. Χαρακτηρίζεται από μια ξαφνική αφθονία ιχνοαπολιθωμάτων σκληρού υποστρώματος.
Στο Κατώτερο Ορδοβίκειο, στους τριλοβίτες προστέθηκαν πολλά νέα βραχιόποδα, βρυόζωα, πλαγκτονικοί γραπτόλιθοι και κόνδυλοι, καθώς και πολλοί τύποι μαλακίων και εχινόδερμων, συμπεριλαμβανομένων των οφιοειδών ("εύθραυστα αστέρια") και των πρώτων θαλάσσιων αστεριών. Παρ' όλα αυτά, οι τριλοβίτες παρέμειναν άφθονοι, με όλες τις τάξεις του Ύστερου Κάμβριου να συνεχίζουν και να προστίθενται στη νέα ομάδα Phacopida. Εμφανίστηκαν επίσης οι πρώτες ενδείξεις χερσαίων φυτών.
Οι τριλοβίτες του Ορδοβίκου ήταν πολύ διαφορετικοί από τους προκατόχους τους του Καμβρίου. Πολλοί τριλοβίτες ανέπτυξαν περίεργα αγκάθια και οζίδια για να αμυνθούν απέναντι σε θηρευτές όπως οι πρωτόγονοι καρχαρίες και τα ναυτιλοειδή. Άλλοι τριλοβίτες εξελίχθηκαν σε μορφές που κολυμπούσαν. Ορισμένοι τριλοβίτες ανέπτυξαν ακόμη και ρύγχη που έμοιαζαν με φτυάρια για να οργώνουν τους λασπώδεις βυθούς της θάλασσας. Ορισμένοι τριλοβίτες, όπως ο Asaphus kowalewski, ανέπτυξαν μακριούς οφθαλμούς για να βοηθούν στην ανίχνευση θηρευτών, ενώ αντίθετα τα μάτια άλλων τριλοβιτών εξαφανίστηκαν εντελώς.
· 
Γεωτρήσεις τρυπανιτών σε σκληρό έδαφος του Ορδοβικίου, νοτιοανατολική Ιντιάνα.
· 
Γεωτρήσεις Petroxestes σε σκληρό έδαφος του Ορδοβικίου, νότιο Οχάιο.
· 
· 
· 
Platystrophia ponderosa, Maysvillian (Ανώτερο Ορδοβίκειο) κοντά στο Madison της Indiana. Η κλίμακα είναι 5,0 mm.
· 
Ένα βραχιόποδο του Ορδοβίκου, στροφομενίδιο, με εγκιβωτισμένα άκαμπτα βραχιόποδα και ένα βρυόζωο.
· 
Zygospira modesta, σπειροειδή βραχιόποδα, διατηρημένα στις αρχικές τους θέσεις πάνω σε ένα τρεπόστομο βρυόζωο- Ιντιάνα.
· 
Γραιπτόλιθοι (Amplexograptus) από το Ορδοβίκειο κοντά στο Caney Springs, Tennessee.
Πρόσφατη ανακάλυψη τύπων Burgess Shale
Η διάσημη πανίδα του Burgess Shale εξαφανίζεται στο Μέσο Κάμβριο. Είναι πλέον γνωστό ότι δεν εξαφανίστηκε, αλλά επέζησε και ευδοκίμησε όπου οι συνθήκες ήταν κατάλληλες. Μια πρόσφατα ανακαλυφθείσα lagerstätte (απόθεση εξαιρετικά διατηρημένων απολιθωμάτων) βρέθηκε στο σχηματισμό Fezouata, στο Μαρόκο. Η περιοχή περιέχει αξιοσημείωτα απολιθώματα μαλακόσωμων ζώων από έναν λασπώδη ωκεάνιο πυθμένα. Η πανίδα περιλαμβάνει επίσης ορισμένα ζώα με σκληρό σώμα, όπως καβούρια πέταλα. Πιθανώς οι συνθήκες χαμηλού οξυγόνου κράτησαν στο ελάχιστο τα αρπακτικά και τα πτωματοφάγα ζώα.
