Όπως και σε άλλα έντομα, το σώμα ενός σκαθαριού αποτελείται από τρία κύρια μέρη: το κεφάλι, το θώρακα (το μεσαίο μέρος) και την κοιλιά (το πίσω μέρος). Στο κεφάλι, τα σκαθάρια διαθέτουν κεραίες (αισθητήρες), μάτια και στόμα. Τα πόδια και τα φτερά του σκαθαριού είναι προσαρτημένα στο θώρακα. Η κοιλιά ενός σκαθαριού δεν έχει συνήθως ειδικά μέρη εξωτερικά, αλλά έχει το έντερο του σκαθαριού στο εσωτερικό της. Όπως και άλλα έντομα, τα σκαθάρια δεν έχουν εσωτερικά οστά, αλλά έχουν έναν σκληρό εξωσκελετό στο εξωτερικό του σώματος. Ο εξωσκελετός αποτελείται από σκληρές πλάκες χιτίνης.
Φτερά
Τα σκαθάρια διαφέρουν από τα άλλα ιπτάμενα έντομα επειδή τα μπροστινά τους φτερά έχουν εξελιχθεί σε σκληρά καλύμματα ή έλυτρα. Τα πίσω φτερά χρησιμοποιούνται για την πτήση. Είναι λεπτά και διατηρούνται κάτω από τα έλυτρα όταν βρίσκονται σε ηρεμία. Τα σκαθάρια σηκώνουν τα έλυτρά τους από τη μέση για να πετάξουν. Λίγα είδη αληθινών σκαθαριών έχουν παρόμοια διάταξη.
Δεν μπορούν να πετάξουν όλα τα σκαθάρια. Ορισμένα σκαθάρια δεν έχουν πίσω φτερά και ορισμένα δεν μπορούν να σηκώσουν τα μπροστινά τους φτερά από τη μέση. Μερικά σκαθάρια δεν έχουν καθόλου φτερά. Ορισμένα σκαθάρια χωρίς φτερά μοιάζουν με προνύμφες και ονομάζονται "λαρβιόμορφα". Ένα παράδειγμα είναι η οικογένεια Phengodidae, τα πυγολαμπίδες, όπου τα θηλυκά είναι λαρβιδόμορφα καθ' όλη τη διάρκεια της ζωής τους.
Πόδια
Τα πόδια των σκαθαριών τα βοηθούν να περπατούν, να τρέχουν, να κολυμπούν και να σκάβουν. Όλα τα σκαθάρια έχουν έξι πόδια. Κάθε πόδι αποτελείται από διάφορα μέρη. Κάθε πόδι καταλήγει σε δύο έως πέντε μικρά τμήματα που ονομάζονται tarsi. Ο τελευταίος ταρσός (ο ενικός του tarsi) κάθε "ποδιού" σκαθαριού έχει ένα ή δύο νύχια στο άκρο του. Τα περισσότερα σκαθάρια χρησιμοποιούν τα πόδια τους για να περπατούν ή να τρέχουν. Ορισμένα πόδια σκαθαριών είναι επίπεδα και έχουν μακριές τρίχες πάνω τους. Αυτού του είδους τα πόδια συναντώνται στα σκαθάρια του νερού. Τα σκαθάρια που σκάβουν συχνά στο έδαφος έχουν επίπεδα πόδια με αγκάθια ή κέρατα στις άκρες. Τα επίπεδα πόδια με κέρατα ονομάζονται απολιθωματοφόρα πόδια. Μερικά σκαθάρια έχουν μεγάλα οπίσθια πόδια, παρόμοια με αυτά των ακριδών, τα οποία βοηθούν το σκαθάρι να πηδάει. Τα σκαθάρια ψύλλων είναι ένα παράδειγμα σκαθαριού που πηδάει.
Όραση και όσφρηση
Τα σκαθάρια έχουν σύνθετα μάτια, πράγμα που σημαίνει ότι τα δύο μεγάλα γυαλιστερά μάτια στο κεφάλι αποτελούνται στην πραγματικότητα από πολλά μικρότερα μέρη. Μερικές φορές τα δύο μάτια χωρίζονται το καθένα στη μέση, έτσι ώστε να φαίνεται ότι υπάρχουν τέσσερα μάτια. Μια οικογένεια σκαθαριών, τα σβούρα, έχει διαιρεμένα μάτια, ώστε όταν κολυμπούν να μπορούν να βλέπουν ταυτόχρονα πάνω από το νερό και κάτω από το νερό. Μερικά σκαθάρια έχουν επιπλέον απλά μάτια (συνήθως δύο) που ονομάζονται οκέλια. Τα οκέλια βρίσκονται στην κορυφή του κεφαλιού του σκαθαριού.
Τα σκαθάρια χρησιμοποιούν τις κεραίες τους για να μυρίζουν τα πράγματα. Τα σκαθάρια χρησιμοποιούν επίσης τις κεραίες τους για να αισθάνονται τα πράγματα γύρω τους. Οι κεραίες των σκαθαριών δεν είναι όλες ίδιες. Ορισμένες κεραίες είναι μακριές και λεπτές, ενώ άλλες είναι κοντές και φαρδιές. Οι λεπτές κεραίες ονομάζονται νηματοειδείς κεραίες, ενώ οι κεραίες που είναι φαρδιές στο άκρο τους ονομάζονται κεραίες με κλωστές.
Το στόμα
Το στόμα ενός σκαθαριού είναι πολύ διαφορετικό από το στόμα ενός ανθρώπου. Τα περισσότερα σκαθάρια έχουν δύο σκληρές γνάθους στο μπροστινό μέρος του στόματός τους που μοιάζουν λίγο με δόντια. Οι γνάθοι βοηθούν το σκαθάρι να τρώει συνθλίβοντας και κόβοντας την τροφή. Σε ορισμένα σκαθάρια, οι γνάθοι μοιάζουν με μεγάλες τανάλιες. Τα σκαθάρια έχουν επίσης τέσσερα "δάχτυλα" γύρω από το στόμα τους που σπρώχνουν την τροφή στο στόμα του σκαθαριού. Αυτά τα δάχτυλα ονομάζονται παλίδες.
Άλλα
Τα σκαθάρια δεν αναπνέουν, αλλά έχουν τρύπες που ονομάζονται σπιράλ στις πλευρές του σώματός τους και οδηγούν σε τραχεία, που λειτουργούν σαν πνεύμονες. Τα σκαθάρια δεν έχουν αίμα, αλλά έχουν κάτι που μοιάζει με αίμα, που ονομάζεται αιμόλεμφος. Έχει πράσινο χρώμα. Αυτό συμβαίνει επειδή το μόριο της αιμοσφαιρίνης τους έχει ένα άτομο χαλκού στο κέντρο του, ενώ το δικό μας έχει ένα άτομο σιδήρου εκεί.